海洋微生物活性物质的研究已成为国内外新药来源研究的热点，红树林内生真菌是研究的主要对象之一。据报道已从红树林内生真菌次级代谢产物分离得到很多具有生物活性的化合物。本论文通过对红树林内生真菌次级代谢产物的研究，来开发广西北仑河口丰富的红树林资源，为广西海洋药物的开发提供基础研究。　　第一章介绍了红树林内生真菌的研究意义，通过近几年来有关红树林内生真菌分离得到具有生物活性新化合物的文献报道来阐述其研究进展，并简介了本课题的来源。　　第二章通过无菌操作及严格的表面消毒，分别对九株采集于广西北仑河口红树林植物（木榄、黄槿、白骨壤、秋茄、老鼠簕、银叶树、桐花树、海漆、海芒果）的茎、叶进行内生真菌的分离，分别从茎、叶分离纯化了14株、6株内生真菌。对分离纯化的菌株进行了液体发酵培养、观察生长形态和次级代谢产物的初步分析研究。　　第三章选取RT02和BgJ1扩大发酵培养，用不同的培养基培养100L，发酵液恒温挥发浓缩后用乙酸乙酯萃取，得到发酵液浸膏;菌体风干后，粉碎，用甲醇浸泡，浸泡液浓缩后合并，得到菌体浸膏。发酵液浸膏和菌体浸膏分别用柱层析、Sephadex LH-20柱层析、重结晶等方法进行代谢产物的分离纯化，共得到17个化合物。通过IR、MS、NMR等光谱技术及文献对照进行结构鉴定，共鉴定了12个化合物，分别为:十八烷酸、13-酮-十八烷酸、12-羟基十八酸、对羟基苯丙酸、环（脯-甘）二肽、十九烷酸、十七烷酸、5-甲基嘧啶2，4(1H，3H)-二酮、Bgefozctcarboxamide、麦角甾-6，8，22-三烯-3-醇、过氧化麦角甾醇、甘露醇。6个未能鉴定的化合物中结构可能为:化合物6、10为多肽，化合物12是四萜，化合物13是麦角甾三烯二醇，化合物16是二烯四环化合物。　　第四章总结了本论文的研究成果，并分析在研究过程中遇到的问题及解决办法，为红树林内生真菌的研究提供研究基础。通过对两株内生真菌的次级代谢产物的研究得到几个多肽化合物，而多肽化合物一般都具有生物活性，这为下一步研究指明了主要方向及方法。