珊瑚(Coral)属于无脊椎动物门中的腔肠类,我国沿海的珊瑚资源主要分布于南海,深圳东部海域也有分布,为研究深圳东部海域造礁石珊瑚的分布、生长及珊瑚礁区的群落结构等情况,运用断带调查法对该海域的珊瑚分布、多样性及覆盖情况进行水下调查,并通过分子生物学手段,选取造礁石珊瑚珊瑚虫16s rRNA序列片段、共生藻28s rDNA序列片段进行分子标记,并利用测出的序列构建NJ系统发育树,分析深圳东部海域造礁石珊瑚的系统发生关系,并研究不同种类造礁石珊瑚与共生藻类型的相关性及共生藻的多样性。研究结果如下:1.在深圳东部海域大澳湾的珊瑚普查中,共记录造礁石珊瑚4科8属13种,多样性指数为2.251,均匀度指数为0.608,优势种以团块状珊瑚为主,夹杂少量叶状珊瑚。频度级关系为A>B=C=D=E,暗示石珊瑚群落稳定性较低。对样带下方的底质覆盖进行统计发现石珊瑚覆盖率大幅下降,并呈现高分布区-低分布区相交错的情况。2.对深圳东部海域常见的4科7属的28个造礁石珊瑚个体的16s rRNA基因片段进行分析,测序结果表明造礁石珊瑚珊瑚虫16s rRNA基因部分序列长度在540-714bp之间。AT碱基含量高于GC含量,呈现AT碱基偏倚特征。造礁石珊瑚属内、属间、科间遗传距离逐渐递增,角孔珊瑚属(Goniopora)珊瑚样本与其他珊瑚样本呈现出较大的遗传距离,运用NJ、MP、ML三种方法构建系统进化树,结果具有相似的拓扑结构。3.对深圳东部海域常见的5科9属15种造礁石珊瑚共生虫黄藻28s rDNA序列片段进行分析,测序结果表明虫黄藻的28s rDNA序列片段长度在515-553bp之间,AT碱基含量略高于GC含量。深圳东部海域造礁石珊瑚共生藻以D系群共生藻为优势系群表现出较高的环境耐受能力,深圳东部海域造礁石珊瑚-共生藻系统对于适应外界压力表现良好。深圳东部海域造礁石珊瑚单一种类只与唯一系群的虫黄藻共生。