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通过SSR分子标记,对中澳技术合作东门桉树项目时期建立的粗皮桉(Eucalyptus pellita)育种群体进行遗传多样性研究,主要结论如下：(1)采用植物基因组试剂盒法提取粗皮桉DNA,在浓度和纯度上均优于CTAB法,所提取的所有样品DNA的浓度在83.4～409.7ng/μL之间,OD260/OD280比值在1.93-2.08之间。对比常规PCR与降落PCR的扩增效果,表明降落PCR优于常规PCR。(2)在9个粗皮桉种源中,筛选出的21对引物,共扩增出253个等位基因,观测到的平均等位基因数(A)为12.05个,多态性比率为100%；平均有效等位基因数(Ne)为4.5504个；Shannon信息指数平均为1.7087；观测杂合度的平均值(Ho=0.5131)明显低于期望杂合度的平均值(He=0.7206),整个育种群体交配方式一定程度偏离随机交配;Nei基因多样性(h)平均值为0.7160；固定指数(F)平均为0.2717,粗皮桉育种群体的杂合体不足。(3)在粗皮桉种源水平上,观测等位基因数最高为种源3(A=7.8095),最低为种源9(A=1.4762)；有效等位基因数最高为种源3(Ne=4.1971),最低为种源9(Ne=1.4762)；Shannon信息指数最高为种源3(I=1.5984),最低为种源9(I=0.3301)；期望杂合度最高为种源3(He=0.7405),最低为种源6 (He=0.4762); Nei基因多样度(h)的变化范围在0.2381～0.7199之间；9个种源中除种源9外,其他种源的固定指数(F)均大于0,杂合体均不足,偏离了Hardy-Weinberg平衡。(4)9个种源按照Shannon信息指数由大到小排序：种源3>种源2>种源1>种源5>种源6>种源4>种源7>种源8>种源9；按照Nei基因多样度指标由高到底排序：种源3>种源2>种源5>种源6>种源1>种源4>种源7>种源8>种源9,与Shannon信息指数的排序相比,种源1的排序下降了两级,其它顺序基本一致。(5)基因分化系数(Fst)平均为0.1605,16.05%的遗传变异存在于种源间,83.95%存在于种源内。基因流(Nm)平均值为1.3079,各种源间存在较高程度的基因交流,遗传分化小。(6)9个种源的遗传一致度在0.5007到0.8690之间,遗传距离在0.1404到0.6918之间。聚类分析结果9个种源被分为4类,第一类为种源1、种源2、种源3、种源7,第二类为种源4、种源5、种源6,种源8为第三类,种源9为第四类。(7)对21个位点进行Hardy-Weinberg平衡的卡方检测(Chi-square test)和似然比率检测(Likelihood ratio test),卡方检测(Chi-square test)中3个位点达到显著水平,显著偏离Hardy-Weinberg平衡,13个位点为极显著水平,极显著偏离Hardy-Weinberg平衡。似然比率检测(Likelihood ratio test)中3个位点为显著水平,9个位点达到极显著水平。(8)对21个位点进行中性检测,所有实际观测值都在置信区间之内,说明粗皮桉群体未偏离中性突变。