从2003年开始,全国国有商贸企业间产生了一股资产重组的浪潮,在这样的大环境下,南京国有商贸企业也开始探寻新的生存方式。2003年底南京市政府推出了一系列改革方案,提出了“彻底改、改彻底”的总体要求,金鹰系重组南京新百,兼并东方商城,雨润系重组南京中商,掀起了南京国有商贸企业资产重组的高潮。本文以新制度经济学中的交易费用理论、产权理论及企业并购理论为基础,从理论动因、社会动因及经济动因三方面对国有商贸企业资产重组做理论分析。以2004--2005年间南京市国有商贸企业为研究对象,对重组前南京商贸行业的整体价值、核心因素进行分析,通过建立均衡模型证明采取横向兼并或混合兼并进行商贸业资产重组的可行性。以综合指数法、股利资本化比例法、现金流量折现法、事件分析法和经济增加值法为研究方法,以金鹰系重组南京新百、雨润集团重组南京中商为实证研究对象,对重组背景、重组过程及重组后企业发展状况分别做分析,从重组前双方背景条件、重组时目标企业被收购价格、二级市场反映状况以及重组前后企业经营绩效四方面进行对比研究,结合国外资产重组的理论知识和实践经验,对南京国有商贸企业资产重组提出了对策建议。最终得出结论,只有在明晰企业产权,健全社会保障制度,建立切实有效的资产定价方法,提高金融服务的层次及范围和整合重组双方企业文化的大前提下,才能实现商贸国企资产重组后政府、企业、社会三方共赢的局面。