铁皮石斛UGPase基因克隆表达分析及部分MYB基因家族分子克隆与温度胁迫分析

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UGPase是植物生长和糖分代谢通路的重要激酶之一,对铁皮石斛的生长和糖分的累积起着至关重要的作用。MYB转录因子家族是植物中最重要的基因家族之一,其中许多成员与植物的抗逆性有着紧密的关系。所以本次实验从这两个面着手研究。首先利用RACE技术克隆得到铁皮石斛UGPase1的全长为3054bp的基因序列,其中开放阅读框长度为1530bp,一共编码了510个氨基酸,预测其编码的蛋白质序列分子量为51.7 kDa,性质为其为亲水性蛋白。对UGPase1基因发育进化树分析发现,UGPase1蛋白仅与油棕和波斯枣有一定的同源性。利用在线软件Expasy和SWISS-MODEL对其蛋白结构进行预测分析。随后利用实时荧光定量PCR技术分析UGPase1在铁皮石斛不同组织,不同生长年龄中的表达量。分析发现,在根茎叶三者相比较的时,根和茎中的表达量远远高于叶片中的表达量。在不同年份石斛材料分析时发现,1年和3年的材料中UGPase1基因整体表达高于6年等重要信息。通过阅读对比分析铁皮石斛多糖累积的文献,发现UGPase1基因的含量可能与糖分累积过程的活跃度和生长状态成正比例。其次一共得到克隆MYB转录因子家族中的12条序列,长度范围在983-2320bp,编码氨基酸范围203-410个之间,对其进行亚细胞预测分析。对已得到的序列建立进化树分析,利用MEME软件分析其氨基酸序列之间的相似性和预测序列的保守结构域。选出一个R1型MYB转录因子DoMYB04,进行蛋白质结构预测分析,之后在利用荧光定量PCR分析该基因在冷热温度胁迫下表达量的变化。实验发现DoMYB04基因表达量与温度的变化存在明显关系。所以推测在温度胁迫中,铁皮石斛植株能够保持正常的生理状态,有可能与DoMYB04基因表达量的变化有关。
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