本研究采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)方法分别构建了杂色鲍(Haliotis diversicolor )的(CT)n微卫星富集文库和大黄鱼(Pseudosciaena crocea)的(AC)n微卫星富集文库,并从中获得大量的微卫星序列,开发出新的标记。杂色鲍的(CT)n微卫星富集文库包含1212个克隆,从中取114克隆测序,获得48条微卫星序列,阳性克隆率为40.5%。从这些微卫星序列中开发出11对具有多态性的微卫星标记。利用24个野生杂色鲍个体检测了这11个标记的多态性,其等位基因数从3个到10个不等,多态信息含量(PIC)为0.148～0.818,观测杂合度0.083～0.913,期望杂合度0.159～0.856。9个位点符合遗传平衡,而位点SA-JMU4和SA-JMU12明显偏离哈代温伯格平衡(P<0.01)。大黄鱼的(AC)n微卫星富集文库包含1440个克隆,从中取257个克隆测序,其中182个克隆含重复数≧10的微卫星序列,阳性克隆率为70.8%。从中设计了26对引物,检测了其中10个位点的多态性,其等位基因数为3～12个,多态信息含量为0.283～0.866,观测杂合度为0.233到0.900,期望杂合度为0.326～0.893。未发现其中存在可能连锁的位点,但除了LYC0044、LYC0046、LYC0053和LYC0060四个位点外,其余位点皆偏离哈代温伯格平衡。论文从技术角度对水产动物微卫星富集文库构建、提高微卫星标记得率的方法进行了讨论;也讨论了杂色鲍与大黄鱼野生群体的遗传多态性问题。本研究新开发的微卫星标记大部分PIC值都高于0.5,适用于各种遗传学分析,它们的出现将会帮助推动杂色鲍和大黄鱼相关研究的进一步深入。