自从改革开放以来，我国的经济就走上了快速发展的道路，人民的生活水平也得到了极大的提高。九十年代以来，我国的股票市场也在曲折中不断前行，从股权分置改革到股指期货的推出，在制度和金融创新方面都有了很大的突破。但是，在同样的宏观经济环境下，主板市场和中小板市场走势出现了较大的背离，产生这种现象的原因必须利用相关的数据进行实证研究才能得出确切的结论。　　 本文以沪深300指数和中小板指数作为主板市场和中小板市场的代表，研究了宏观经济的不同因素对两大股票市场的不同影响。本文首先分析了主板市场和中小板市场的特点以及经济发展状况对股票市场可能造成的影响，然后选取了2006年10月至2012年12月股票指数以及相关宏观经济指标的月度数据进行了实证研究。本文首先对时间序列的数据进行了平稳性检验，然后在此基础上对符合条件的变量进行了协整回归，找到了相应的回归方程，并比较了对主板市场和中小板市场影响的不同因素。最终，本文得出了如下结论：主板市场和中小板受到宏观经济因素影响的差异表现在，主板市场受到工业增加值增速和货币供应量的影响，而中小板市场更多受到利率水平和净出口额的影响，并且物价上涨对于两个市场的影响方式也不一致。