农业保险合同的履行不仅是农业保险合同法律效力的主要内容，而且也是整个农业保险合同的核心。农业保险合同履行的关键环节主要体现在农业风险损失程度的确定以及损失赔偿的给付等方面。但农业风险损失程度的确定比其他财产保险要复杂得多，尤其是如何有效的预防和控制道德风险和逆向选择的发生、提高农业保险信息的对称性和透明度以及减少农业保险的交易成本等问题都成为农业保险合同履行的难点和重点。同时，由于农业保险是一种政策性保险，其履行的原则、义务、程序等环节上，都呈现出不同于一般保险合同履行的特点，政府在农业保险合同履行过程中的作用机制尤为特殊。在农业保险合同履行过程中涉及的主体不仅包括投保人、被保险人和保险人，还应包括各级政府部门、龙头企业、中介组织等；以保护弱势群体即投保人、被保险人的权益为出发点，在遵行适当、协作、经济合理的履行原则之时，应侧重于从合同履行的各个阶段为投保人和被保险人着想；对投保人和被保险人来说，交纳保费属于给付义务，而如实告知、维护保险标的物正常生长状态、重要事项的通知等则属于附随义务；对保险人来说，赔偿损失属于给付义务；各方当事人履行各项义务时，应趋于非要式、多样化，这样更加有利于防范逆向选择和道德风险问题的发生；为了适应信息时代的需求，在农业保险合同履行的各个环节都应倡导和鼓励履约新技术的运用，从而实现履约公开、公平的同时，兼顾效率。