目前,多元化作为上市公司普遍存在的经营方式已暴露出许多潜在的问题。农业类上市公司作为农业产业化的重要载体,是资本市场与农业现代化的有机结合。国家对农业上市公司采取了许多积极的优惠政策,然而众多农业上市公司却走上了背农经营的道路。因此,深入研究背农经营的动机与根源,无论对于农业上市公司的实际运营,还是对于农业上市公司理论研究都具有重要意义。本文首先从理论上探讨了农业上市公司背农的动机,然后进一步以股权结构为出发点,通过探讨股权结构、背农经营和公司价值三者关系后提出研究假设。并在此基础上,利用我国农业类上市公司2009-2014年间的数据,验证了股权结构与背农的相关关系、并从股权结构引发代理问题角度对农业上市公司背农经营折价作了解释。本文的研究结果表明,控股股东与背农程度正相关,背农程度与公司价值负相关。国有股比例越高,公司价值越小,法人股比例越高,公司价值越大,流通股比例越高,公司价值越小。农业上市公司股权集中度与公司价值正相关。背农公司中存在的股权结构与背农程度之间的关系,进一步解释了背农折价的原因。论文在研究过程中,借鉴了国内外已有的实证研究成果,采用了SPSS统计方法,并对影响因素作了回归分析。股权结构理论不仅解释了农业上市公司背农的动机与背农折价的原因,也展示了我国农业类上市公司的治理结构特点。