古菌、细菌和真核生物是生物分类中的三个域。古菌在细胞结构上与细菌比较接近,而在遗传和生理生化上却与真核生物比较相似。古菌主要包括三个门：泉古菌门、奇古菌门和广古菌门。这些古菌门下的微生物参与了生物地球化学中的碳氮等循环,例如氨氧化反应、甲烷反应等。目前,很多研究主要集中在土壤中细菌和真菌的分布及影响土壤中细菌和真菌分布的因素,并发现土壤pH是影响土壤中细菌和真菌的重要因素。然而,有关微生物尤其是古菌的大尺度空间分布及其驱动因子的研究很少。因此,本论文就针对中国纬度地带性土壤中古菌群落结构分布及影响古菌群落结构分布的环境因素与土壤理化性质进行研究。通过中国纬度地带性土壤古菌群落结构分类学鉴定结果可以看出,序列鉴定结果较好,只有平均0.06%的序列不能被鉴定。在被鉴定为古菌的序列中,主要被鉴定为奇古菌门和广古菌门微生物。北方土壤中基本没有广古菌门微生物的存在；奇古菌门微生物主要被认为是包含氨氧化古菌的门,而在北方土壤中奇古菌门微生物主要是具有亚硝基化功能的Nitrososphaera菌群,在南方土壤则是奇古菌门下具有亚硝基化功能的Nitrosotalea菌群。但在古菌分类学鉴定中,很少有古菌能鉴定到目水平。在中国纬度地带性土壤古菌群落结构多样性指数计算中,样品Coverage指数平均有0.738,样品完整度较好。Chao、Shannon和Simpson指数等也呈现了明显的南北差异性：主要是这三个指数在北方土壤中比较均一；而在南方土壤中均一性比较差,有的省份差异很大,有的省份差异很小。在贝塔多样性指数Jaccard指数中也可以明显看出南北差异,同时南方省份也可分为两个组分。环境因素与土壤理化性质对中国纬度地带性土壤古菌群落结构多样性影响的研究中,通过典范对应分析(CCA)和多元回归树(MRT)研究了环境因素与土壤理化性质对土壤古菌群落结构及多样性指数的影响。在CCA结果中可以明显看出中国纬度地带性土壤呈现明显的南北差异,同时也发现南方省份存在分组。土壤pH、年均降雨量(R)和年均气温(T)这三个因素对土壤古菌群落结构南北差异起主要的影响作用,而无定形氧化铝(Alo)是南方省份分组的主要因素。在MRT分析中,多样性指数也存在南北差异,而古菌纲水平上主要受到pH而产生南北差异。