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2009-2011年对西双版纳热带植物园(XTBG)内的三种雌雄异株的榕树：苹果榕(Ficusoligodon)、对叶榕(F.hispida)、鸡嗉果榕(F.semicordata)以及两种雌雄同株的榕树：垂叶榕(F.benjamina)和顿叶榕(F.curtipes)隐头果分别在榕小蜂进入前、后进行内生真菌的分离与鉴定。5种榕树中共分离得到1983株内生真菌,经鉴定属于18个属,其中镰刀菌属(Fusarium)、刺盘孢属(Colletotrichun)和小丛壳属(Glomerella)在所研究的5种榕树中均有发现,为常见种群,且所占比例均远远高于其他内生真菌。另外在苹果榕、对叶榕、鸡嗉果榕和垂叶榕中还大量分离得到一常见种群青霉菌属(Penicillium),但是在顿叶榕中却没有发现。在分离得到的18个属中,鸡嗉果榕隐头果内分离得到的内生真菌包含了12个属,为所研究的5种榕树中分离得到属最多的榕树；其次是苹果榕隐头果,分离得到10个属；对叶榕和顿叶榕均分离得到9个属；而垂叶榕上分离得到的内生真菌仅为6个属,是5种榕树中最少的。在苹果榕雌树和对叶榕雌树中还分别分离得到一株形态和分子手段目前尚无法鉴定的内生真菌。研究结果表明,镰刀菌属(Fusarium)、青霉菌属(Penicillium)、小丛壳属(Glomerella)和刺盘孢属(Colletotrichun)为优势种群。小蜂进入前、后,5种榕树上分离得到的内生真菌种群基本相同,均为优势种群,变化比例较小。其它真菌所占比例很小,属于偶见类群。此外,某些特定真菌只在部分榕树中少量存在,这可能是由于环境不同或者进入榕果内小蜂的身上所携带真菌不同,且在榕果内发育并在榕果内定植,从而导致真菌种类的不同。通过对榕树中内生真菌定植率的比较研究发现,雌雄异株榕树中的内生真菌在雌树和雄树中的定植率不同,但差异不显著；内生真菌定植率除在对叶榕雄树中略有降低外,在其他榕树中进蜂后内生真菌的定植率比进蜂前有所增加,并且垂叶榕中内生真菌的定植率增加幅度最大,而苹果榕雌树进蜂前、后内生真菌的定植率没有发生变化；在所研究的榕树中,总定植率在42.00%-59.38%之间波动。雄树和雌树在小蜂进入前、后的内生真菌群落基本相同,但所占比例略有不同,且优势种群的变化更小,说明榕小蜂的进入对榕树隐头果中内生真菌的群落组成影响不大。可见在植物体内环境中,不同的微生物相互作用,建立一种动态平衡,并在植物体内形成一种相对稳定的真菌群落,其中一部分属于优势种群,相对稳定,分离频率高；而另一部分则属于稀有种群,当样本数量不足时有可能会遗漏部分分离频率小的稀有真菌。