牙鲆(Paralichthys olivaceus)性别表现QTLs和环境(温度)的相互作用

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wu19851110
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由有丝分裂雌核发育所生产的牙鲆(Paralichthys olivaceus)双单倍体(doubled haploid,DH),具有极高的遗传纯合度,是杂交育种的理想材料。然而,牙鲆双单倍体个体的生存力和繁殖力往往极低,无法满足杂交育种设计所需要的足够数量且各具特色的育种材料,更不能直接作为亲本供种。研究表明,个体的生存力与偏分离基因密切联系。目前,牙鲆的性别决定依然是一个复杂而未解的问题。普遍认为,染色体上的基因和温度变化与牙鲆的性别决定有关。本研究利用有丝分裂雌核发育技术获得双单倍体卵,孵化40日后,平均分成3组,分别在20℃,24℃,28℃养殖至150日,最终建立包含212个双单倍体的DH群体。基于该群体,进行性别表现的基因以及基因与环境(温度)之间相互作用研究。具体成果如下:1.利用272个有效的多态性SSR标记,基于软件MapDisto矫正偏分离构建遗传图谱,和软件JoinMap 4构图结果进行了比较:矫正图谱观测总长度为1961.02cM,平均图距9.61cM,图谱覆盖率达80.80%;未矫正图谱观测总长度为945.31cM,平均图距4.22cM,图谱覆盖率达80.46%。另外,部分标记的相对位置和遗传距离发生了变化。2.基于矫正和未矫正偏分离图谱,利用矫正和未矫正偏分离标记条件概率,采用Bayesian模型进行牙鲆性别表现QTL定位。结果发现:1)不同方法检测的性逆转加性QTL和上位性QTL的结果有所不同;2)性别表现加性QTL的遗传率(0.1%~4.95%)和加性效应值都很低;3)性别表现上位性QTL对表型变异起主要贡献,可解释表型变异的9.69%~19.05%、3.20%~22.07%、5.88%~18.08%和8.66%~16.62%。在矫正图谱中,利用矫正条件概率进行牙鲆性别表现QTL定位,检测到3个加性QTL,分别位于5[48.51]、12[14.30]和20[0.00]。位于5[48.51]QTL可解释解释表型变异的3.97%,具有负向加性效应,基因环境互作效应值为0.148;位于12[14.30]QTL可解释表型变异的3.36%,具有正向加性效应,基因环境互作效应值为0.014;位于20[0.00]QTL可解释表型变异的3.23%,具有负向加性效应,基因环境互作效应值为-0.061。同时,加性×加性互作上位性QTL数为10,主要分布在1号、2号、4号、5号、8号、10号、11号、19号、20号和23号连锁群,最大遗传率上位性QTL位置为19[176.47]×23[23.95]。3.基于矫正和未矫正偏分离图谱,利用矫正和未矫正偏分离标记条件概率,采用阈模型剖析生存力遗传结构。结果发现:1)矫正偏分离标记条件概率与否,对生存力SDL定位没有影响;2)在矫正图谱和未矫正图谱中,SDL定位结果有所差异;3)主效应SDL对生存力的遗传贡献率很低(<1%)。在矫正偏分离图谱中,检测到1个致死基因12[11.38],可解释生存力变异的0.41%。本研究结果可为今后牙鲆重要经济性状QTL定位研究提供借鉴,并为今后进一步MAS育种和性状改良提供参考。
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