癌症作为一个关注度极高的问题，已引起了广大研究者不断深入的研究。癌症研究涉及多方面的内容，肿瘤遗传学是其中一个重要的分支，它主要包括三方面内容:遗传变异研究、体细胞变异研究、表观遗传学研究。就目前研究现状来看，表观遗传学的研究已有一定深度。相应的表观遗传学药物已研究成功并通过批准上市。表观遗传学主要涉及脱氧核糖核酸(DNA)甲基化、染色体重塑、非编码核糖核酸(RNA)调控及组蛋白修饰等。研究发现，表观遗传调控异常会引发人类的多种疾病，如癌症、炎症、精神性疾病、代谢性疾病等。因此，对表观遗传调控异常的治疗在治疗疾病方面意义重大。　　本论文首先综述了目前关于组蛋白去乙酰化酶及其抑制剂的研究进展及现状，并从以下几个方面开展具体工作:　　(1)吲哚类组蛋白去乙酰化酶抑制剂小分子配体的设计及合成:设计合理的吲哚类化合物的合成路线，并对其反应条件进行优化，为系列吲哚类化合物的合成工艺研究做好铺垫。以最佳反应条件，设计合成了34个吲哚类化合物，并利用高分辨质谱(HRMS)、核磁共振氢谱(1H-NMR)、核磁共振碳谱(13C-NMR)等方法对这些化合物进行了结构鉴定。　　(2)黄酮类组蛋白去乙酰化酶抑制剂配体的设计及合成:设计合理的黄酮类化合物的合成路线，并对其反应条件进行优化，为系列黄酮类化合物的合成工艺研究做好铺垫。并以最佳反应条件，设计合成了10个黄酮类化合物，并利用MS、1H-NMR、13C-NMR等方法对这些化合物进行了结构鉴定。　　(3)对这些化合物进行了抗肿瘤活性研究。采用MTT进行了体外的抑制肿瘤细胞增殖活性评价，以期找到高活性的化合物。　　本论文共合成了2个系列44个小分子化合物，所有合成的化合物均采用1HNMR、13C NMR和HRMS等表征手段进行了结构确证。经过文献查找，其中39个为新化合物，未有文献报道。