电喷雾质谱法采用软电离方式，在蛋白质的电离过程中能够使蛋白质带上多个电荷，从而能够在低质量范围的检测器中检测到。同时，电喷雾质谱法还具有快速，高灵敏，高特异性的特点，在众多生物化学研究领域得到广泛应用。因其采用的软电离方式，能够在比较温和的条件下保持生物大分子和复合物的天然结构，从而在非共价键复合物的研究中起着不可替代的作用。在电喷雾质谱法中，仪器参数的设定很大程度的影响到待测样品的信号检测。合适的仪器条件能够同时保证待测样品具有足够强的信号响应，同时还能保证蛋白质及其复合物的天然构型。本课题考察了各个仪器参数对于乙醇脱氢酶信号的影响。结果表明，在ESI-MS检测过程中，乙醇脱氢酶大多以单体和二聚体形式存在，乙醇脱氢酶多聚体的观察受流动相中有机溶剂的影响最大。当流动相中乙腈的含量达到30%时，乙醇脱氢酶以二聚体为多，同时能够观察到少量的四聚体存在。本文分别选取辅酶烟酰胺腺嘌呤二核苷酸和脱氢酶抑制剂4-甲基嘧啶作为底物与乙醇脱氢酶混合并运用ESI-MS来检测是否形成非共价键复合物，检测结果未观察到复合物的形成，说明乙醇脱氢酶与底物的结合与其天然四聚体的活性结构有关系。同时，本课题还构建了一套利用超滤质谱法来快速筛选与生物大分子作用的小分子物质的模型。超滤质谱法是利用超滤装置与质谱仪器相结合，能够在溶液状态下高通量的快速的筛选出对复杂样品中与特定生物大分子相结合的小分子物质。与其他方法相比，超滤质谱法具有快速、灵敏、高通量的特点，对于天然产物中有效成分的筛选和先导药物开发具有重要意义。我们将大豆异黄酮粉提取物与人血清白蛋白按照一定比例混合孵育，将未与人血清白蛋白的配体小分子超滤洗去，然后用有机溶剂将与人血清白蛋白结合的配体小分子洗脱下来，通过建立空白对照组来排除超滤膜的非特异性吸附和操作过程中引起的误差，最后用ESI-MS对洗脱下来的小分子进行检测。实验结果表明，超滤质谱法能够很好的筛选出大豆异黄酮粉中大豆苷，染料木苷，大豆苷元，染料木素等四种与人血清白蛋白具有结合能力的大豆异黄酮物质。此方法利用超滤装置与高效液相质谱联用有效的避免了样品中复杂基质的干扰，大大的提高了分析的选择性和操作的简便性。同时，能够在一次操作过程中同时筛选出多种与生物大分子作用的配体小分子，非常适合于从复杂天然产物提取物中同时筛选多种有效成分，具有高速高效的优点。