代谢中间物参与表观遗传动态调控及促进肿瘤发生相关分子机制研究

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异柠檬酸脱氢酶基因/DH1/2是最常见的在肿瘤中发生高频率突变的代谢基因。IDH主要是催化异柠檬酸的氧化脱羧反应,生成α-酮戊二酸(α-KG)。突变IDH丧失其正常生成α-KG活力的同时,还获得了一种全新的活力,即催化α-KG生成2-羟戊二酸(2-HG)。我们的研究结果表明,IDH突变累积的2-HG因其与α-KG结构相似而成为α-KG的拮抗物,能够竞争性地抑制一系列以α-KG为底物的双加氧酶的活力,其中包括组蛋白去甲基化酶KDM和TET家族DNA羟甲基化酶,从而导致全基因组水平的组蛋白和DNA甲基化状态的改变。已知组蛋白和DNA甲基化修饰都会引起染色质结构和基因转录活性的变化,从而可能影响干细胞或前体细胞的分化,最终促进肿瘤的发生。接下来,本论文将研究重点放在了5-甲基胞嘧啶羟基化酶TET的活性调控及其病理生理意义。5-甲基胞嘧啶羟基化酶TET家族利用a-KG以及单核非血红素铁(Fe2+)作为协同底物和辅助因子,催化一系列连续的氧化反应,将5-甲基胞嘧啶(5mC)依次氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),5-甲酰基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC),最终使DNA去甲基化。通过免疫组化和点杂交分析,我们发现在众多类型的人类肿瘤(如肝癌、肺癌、乳腺癌、胰腺癌和前列腺癌)中,5hmC水平显著低于正常癌旁组织。在乳腺癌和肝癌中,5hmC水平降低伴随着TETs基因表达的下调,这为解释肿瘤组织中5hmC水平普遍降低提供了一种可能的分子机制。我们还发现,在不同基因型的小鼠肿瘤组织中,5hmC水平也显著低于正常组织。基于“5hmC水平在肿瘤组织中普遍降低”这一现象,我们认为,5hmC可能成为一个全新的肿瘤诊断标记物,应用于肿瘤的临床诊断。在正常生理条件下,通过对小鼠进行腹腔注射葡萄糖、谷氨酸或谷氨酰胺,我们能够改变小鼠肝脏及其他代谢相关组织中的a-KG水平。我们惊奇地发现,伴随着小鼠肝脏中a-KG水平改变,5hmC的水平也发生变化,且两者显著正相关。这一研究结果表明,葡萄糖、谷氨酸和谷氨酰胺等代谢物可以通过改变a-KG水平,调节TET酶活性,从而实现对5hmC水平的动态调控。另外,我们发现用维生素C处理小鼠胚胎干细胞系E14,可以快速升高5hmC的生成水平,一系列双加氧酶抑制剂(如CoCl2, DFO和DMOG)能够有效抑制维生素C诱导的5hmC水平升高。这一结果表明,维生素C可能通过维持或增加细胞内二价铁离子(Fe2+)的水平,增强TET酶活性,从而促进5hmC不断积累。可见,在细胞和机体,DNA羟甲基化酶TET活力受到多因了的动态调控。综上所述,我们发现,IDH突变导致2-HG异常积累,通过抑制组蛋白去甲基化酶KDM和DNA羟甲基化酶的活力,改变细胞内组蛋白和DNA的甲基化水平,从而可能与肿瘤发生密切相关;在肿瘤组织中,5hmC水平普遍显著下调,表明5hmC可以成为一个新的肿瘤诊断标记物,应用于肿瘤的临床诊断;5hmC作为一种去甲基中间物,其在细胞和机体中的水平通过DNA羟甲基化酶TET受到动态调控。
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