经济全球化进程的加速、全方位的改革开放使我国的市场经济得到了快速的发展,这也给我国的高等教育带来了难得的发展机遇。有机遇必然就有挑战。高等教育面临高速发展的同时,管理问题也日趋突现,因此管理在高等教育中的作用显得越来越重要,要成为一流的高校必须实施一流的行政管理。当我们为国内许多一流高校取得的业绩赞叹不已、为国际一流高校的卓越成绩惊叹万分时,我们也应看到这些高校在行政管理方面的独特做法。如果想成为一流高校,高校行政管理就不能停留在经验管理的水平上,必须摒弃靠增加数量规模,不求提高效益的发展模式,转向从内涵上挖掘潜力,提高效益;必须加强高校行政管理能力,提高行政管理水平,增强有效管理。而高校行政部门在提高高校绩效方面具有重要的作用,行政部门绩效考核指标体系与学校行政部门绩效的提高又息息相关,所以寻找适当的绩效考核指标体系,对高校行政部门提高服务协调质量、办公效率等方面的绩效都具有重要的意义。本文运用阅读文献、调查咨询相关专家等方法,阐述高校行政部门绩效考核指标设计的现实问题,并对这些问题的原因进行了合理的分析判断。对所调研到的问题,有些研究文献资料已经提到了高校行政部门的特殊性、差异性将会影响考核指标的设计,却没有很好地对它进行具体的区别分析和运用。本文针对当前高校行政部门绩效考核指标设计过程中存在的问题,试图结合考核对象分析法、结构模块法等方法对影响考核指标设计的考核对象、考核主体进行分析,进而提出进行指标有效设定的三个关键:即关注高校行政部门绩效内涵分析、关注高校行政部门内部利益相关者、关注高校行政部门服务对象及部门协调相关度的观点。在实证研究中引入平衡计分卡理论,根据CX大学实际情况,分析其行政部门的战略主题,通过大量的问卷调查,初步确定考核共性指标,随后运用因子分析法和层次分析法来检验指标、量化指标,利用实证数据提出对行政部门平衡计分卡四个维度进行修正,选取某个部门进行个性指标的设计。最终构建了以CX大学为代表的高校行政部门绩效考核指标体系。