【摘 要】
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该研究利用生物信息学与分子生物学技术相结合的方法,克隆和定位了这两个家族的12个基因(PA28家族的2个基因和PA700家族的10个基因),取得了如下结果:1.结合猪EST数据库的信息和cDNA末端快速扩增(RACE)的方法,分离并鉴定了猪蛋白酶体激活因子PA28α和PA28β基因(PSME1和PSME2)的全长cDNA序列,GenBank数据库收录号分别为AF527990和AF527991.2.
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该研究利用生物信息学与分子生物学技术相结合的方法,克隆和定位了这两个家族的12个基因(PA28家族的2个基因和PA700家族的10个基因),取得了如下结果:1.结合猪EST数据库的信息和cDNA末端快速扩增(RACE)的方法,分离并鉴定了猪蛋白酶体激活因子PA28α和PA28β基因(PSME1和PSME2)的全长cDNA序列,GenBank数据库收录号分别为AF527990和AF527991.2.用RT-PCR的方法,我们对PSME1和PSME2基因进行了组织表达谱分析.3.利用电脑克隆、RACE和RT-PCR的方法相结合,克隆了蛋白酶体激活因子PA700相关基因PSMC1、PSMC4和PSMC5共3个基因的全长cDNA序列,以及PSMC2和PSMD4基因的完整编码区(coding sequence,CDS).进行了蛋白质序列的推导和功能域的预测.4.根据猪EST数据库的已有数据,利用PCR的方法,分离了PSMC1-PSMC6和PSMD2-PSMD5共10个基因的基因组DNA片段并经测序确认.5.用SCHP和IMpRH克隆板,对PSME1和PSME2基因进行了染色体区域定位和精细定位.6.用IMpRH克隆板,对PA700基因家族的10个基因进行了精细定位,结果表明,它们分布在8条不同的染色体上.7.对PA28的2个基因和PA700的10个基因共12个基因进行了SNPs的检测.8.对上述10个可用PCR-RFLP方法检测的SNPs在二花脸、梅山猪、藏猪、清平猪、杜洛克和大白猪中进行群体遗传学分析.9.在试验杂交群体(L×YT;Y×LT)的上下代中检测了这10个SNPs的遗传方式,均呈共显性遗传方式.10.在荷兰学者赠送的资源家系中,对PSME1基因第八内含子SphI-RFLP的多态性与部分生产性状进行了关联分析.11.在该室与通城县畜牧局合作组建的试验群体中,采用方差分析的最小二乘分析法,对上述SNPs(除了PSME1基因,PSMC5基因TaiI-RFLP、DdeI-RFLP和PSMD2基因)与部分生产性状(如:初生至上市平均日增重、达90kg或75kg的日龄、屠宰率、肌肉pH值等)、部分免疫性状(如:白细胞数、红细胞数、20周龄时血清中IgG的含量等)进行了初步的关联分析.
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