随着国际市场竞争程度的不断加深，区域经济联合成为当今世界各国经济发展的主要趋势。闽台农业合作作为一种特殊的区域经济联合方式，在优化闽、台农业资源配置，拓展农业发展空间中起着举足轻重的作用。近几年来，闽台农业合作步伐不断加快，在深度和广度上都取得了显著成效，台湾较丰富的资金和技术为福建农业发展注入了新的生机，而福建相对廉价的劳动力和土地资源成为台湾农业转型升级的不竭动力。但两地在农业合作中也暴露出了合作规模小，合作层次低等问题，因此深入研究闽台农业合作，对进一步优化两地农业资源配置，提升农业国际竞争力具有重大的理论价值和现实意义。 本论文从优化农业资源配置的角度出发，将闽台农业资源作为一个有机的整体加以研究：首先对闽台农业合作现状进行回顾；其次，根据傅道臣提出的资源配置效率模型，对福建和台湾的农业资源配置效率分别进行了测算和评价，并对两地农业资源优势差异进行了分析；第三，从理论层面和现实层面对闽台农业合作促进资源优化配置进行了分析，揭示了闽台农业发展之间的内在联系和互动关系；应用对比分析法，对闽台农业合作优化福建农业资源配置进行了实证分析；最后从政府和企业两个层面提出闽台农业进一步合作的对策建议。