猪流行性腹泻病毒实时荧光RT-LAMP检测方法的建立

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:terrychou
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猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcineepidemic diarrhea virus,PEDV)引起的猪的一种高度接触性肠道传染病,该病对全世界养猪业造成了重大经济损失。目前,实验室常用的检测PEDV的方法有RT-PCR和ELISA等,但由于其需要专业人员和昂贵的仪器设备而在临床使用中受到限制。实时荧光逆转录环介导等温扩增技术(RT-LAMP)具有快速、灵敏等优点,目前国内外尚无检测PEDV的实时荧光RT-LAMP检测方法。  本研究从保定某发病猪场采集疑似PEDV的粪便样本,将处理好的样本接种Vero细胞,盲传至第五代时,细胞开始出现明显的CPE,通过RT-PCR及测序结果证实该分离毒为PEDV,命名为HB-LX株。利用该毒株,根据GenBank中已登录的PEDV基因序列,在其N基因保守区域设计了6条实时荧光RT-LAMP引物,利用ESE-QuantTube Scanner检测系统,对实时荧光RT-LAMP内外引物的浓度比,镁离子、dNTPs、Bst DNA聚合酶、螯合剂的浓度进行了优化。结果显示,25μL反应体系中,固定外引物F3、B3的量各为0.5μL,当外引物与内引物的量为1∶4,螯合剂的量为1.0μL,Bst DNA聚合酶的量为0.5μL,Mg2+的量为1.0μL,dNTPs的量为5.0μL时,62℃,反应1hr,扩增效果良好。利用优化的反应体系与条件进行了特异性和灵敏性试验。结果表明,该检测方法特异性好,敏感性是RT-PCR的10倍。60份临床样品检测表明,实时荧光RT-LAMP对临床样品的阳性检出率为93%,高于RT-PCR。  本研究建立了PEDV实时荧光RT-LAMP检测方法,该方法可在恒温条件下(62℃)1hr完成RT和LAMP扩增,特异性强,敏感性高,而且结果判定简单,无需电泳即可实现肉眼可见的扩增效果,可用于基层或现场疫病诊断。
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