农业科技投入是推动农业科技创新和提高一国农业科技发展水平的关键。从总体来看,我国农业科技投入总量、不同领域的投入结构等方面都存在严重问题,一定程度上制约了我国农业发展整体效益的提升。我国政府财政投入作为科技投入主体,对农业发展起重要的引导作用。2015年“中央一号文件”明确提出要强化农业科技创新对农业发展的驱动作用,加快推动中国特色农业现代化。作为我国财政农业科技投入重要组成部分的科研投入,虽然呈现逐年增长态势,但是投入总量依然偏低,财政农业科研投入强度不高,与世界发达国家相比存在较大差距。另外,受资金管理体系不够完善等因素的影响,严重制约了我国财政农业科研投入效益的提高。因此,本文重点分析了我国财政农业科研投入效益问题。本文以2015年政府工作报告为导向,从我国财政农业科研投入的基本概念出发,简要阐述了外部性和公共选择理论、投入与产出理论、经济增长理论等,奠定了本文的理论基础。全面分析了我国财政农业科研投入的总体现状(概况、结构、效益),从定量的角度分析了财政农业科研投入的绝对规模和相对规模;通过协整检验得出我国财政农业科研投入对产出的效益,同时借助C-D生产函数模型计算出我国农业科技进步贡献率。运用定性与定量分析相结合、计量模型分析等研究方法,总结分析制约我国财政农业科研投入效益的有关因素。具体包括:资金投入总量不足、投入结构不合理、管理体制不完善等。在此基础上,结合我国政府对农业科研投入的现状,提出提高我国财政农业科研投入效益的相关对策建议。政府在构建我国财政农业科研投入新体系、加强农业科研投入管理、优化农业科研投入环境等方面要发挥主导作用,同时要构建科学完善的绩效评价体系。使我国财政农业科技投入与农业经济增长、农民增收之间形成相互促进的良性循环机制,在促进我国财政农业科研投入与农业经济发展、农民增收之间相互促进的可持续健康发展状态的同时,实现科技兴农的目标,推动我国的农业现代化。本文的相关研究结论,对当前调整我国财政农业科研投入整体思路、明确财政资金对农业科研的投入方向,发挥政府在农业科研投入中的触发效应,提高我国财政农业科研投入效益,具有重要的理论与现实意义。