目的：探寻前列腺癌激素依赖(LNCaP)与激素非依赖(PC-3)细胞株中microRNA-101及EZH2表达差异。流式细胞术分选CSCs,并比较前列腺癌激素依赖CSCs与激素非依赖癌CSCs中microRNA-101及EZH2表达差异,探讨前列腺癌干细胞特异性分子靶点。方法：采用无血清悬浮培养体系(serum-free medium, SFM)培养前列腺癌LNCaP及PC-3细胞富集前列腺癌干细胞,流式细胞术分选SFM细胞CD133+CD44+双阳性细胞(CSCs); RT-PCR及荧光定量PCR检测CSCs中miR-101及EZH2基因的表达,比较其在PC-3与LNCaP、PC3 CSCs与LNCaP CSCs中的表达差异。结果：PC-3细胞经悬浮培养扩增后,CSCs比例显著提高(p<0.05), LNCaP细胞经悬浮培养扩增后CSCs含量无明显改变。前列腺癌PC-3细胞株中miR-101表达量是LNCaP的26.8%,而EZH2的表达显著上调达6.681倍。PC-3 CSCs中EZH2的表达显著高于LNCaP CSCs表达,且二者均明显高于贴壁细胞中的表达(p<0.05)。结论：前列腺癌激素非依赖细胞株较激素敏感细胞株miR-101及EZH2表达显著改变；在前列腺癌CSCs中,EZH2基因的表达显著上调,具有一定的癌干细胞基因水平特异性,尤以激素非依赖前列腺癌CSCs较为显著。其可能主导前列腺癌激素非依赖、耐药以及侵袭转移等生物学特性。