近年来,我国对于古镇人居环境质量评价的研究逐渐增多,但是在研究的过程中缺乏分类和针对性。其中一类就是大运河沿线古镇的人居环境。随着2014年中国大运河申遗成功,大运河沿线古镇的人居环境质量受到广泛关注。而在大运河沿线古镇的人居环境的研究中,没有能够将古镇与大运河紧密相连,得到的数据和结论不具有针对性和代表性。基于以上现状,本文力求能够在大运河文化遗产的背景下,考虑大运河的相关要素,将大运河与古镇人居环境融合到一起,建立一套科学的大运河苏州段古镇人居环境质量评价体系,为大运河苏州段的古镇提供直接改善人居的有效方法,也可以为大运河其他段沿线的古镇提供借鉴方法。首先通过研究国内外的大运河文化遗产、人居环境质量、大运河沿线古镇人居环境质量评价的研究现状,结合文献资料、调研结果、相关法律法规,进行了评价指标的初选;其次通过相关性分析对指标进行了优选,确定了最后的指标集;然后通过层次分析法对指标进行了赋权,得到一套完整的评价指标体系;最后挑选具有代表性的古镇:大运河穿镇而过的代表镇平望镇、毗邻大运河的代表镇盛泽镇,运用模糊综合评价法进行了分析。研究结果:（1）权重结果显示生态环境和居住环境是大运河苏州段古镇人居环境质量的最重要的两个影响因素。（2）评价分析结果显示人们对于大运河苏州段古镇人居环境质量较为满意,整体水平处于中等偏上,但是两种类型的古镇在运河噪音等因素上略有区别。并且,也有部分指标人们对其满意度不高,处于中等偏下的水平,例如运河文化遗产保护情况还是比较欠缺的。针对于这些问题,从制度、管理、宣传、共治四个方面提出了解决对策,用以提高人居环境质量。