本文从建筑保护、使用功能、工程技术和经济分析四个方面对闽南高校石砌建筑进行研究,构建一套关于闽南高校石砌建筑保护改造设计较为全面的框架体系,从工程设计角度展示了保护改造的整体思路和一般方法。闽南高校石砌建筑是特定历史时期的产物,是我国建筑从传统建造方式向现代建造方式转变过程中的过渡时期重要建筑类型,蕴含了非常丰富的价值,应予以保护使其存续。在保护的前提下,可通过对内部空间和布置进行调整、空间采用共享使用、主要延续原有使用功能、少量改变原功能等方式,对石砌建筑进行合理利用,并能适当提高石砌建筑的使用强度;可通对石砌墙、钢筋混凝土梁为主的建筑构件进行加固以及消防、节能、无障碍、智能化设施进行改造等工程技术措施,提高石砌建筑的抗震性能、舒适性和现代化、智能化程度。石砌建筑保护改造后可以满足高校近期使用需求,提高教学科研办公条件,并使高校校园文化得以传承。石砌建筑保护改造模式同拆除新建模式相比,狭义经济效益略差(案例差值约为2%),但具有更好的社会效益和环境效益。