河北地区主栽杨树品种DNA条形码的研究

来源 :长春理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yang176239053
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杨树是我国用于造林护岸、防风固沙、水土保持、园林绿化的主要树种,它以生长迅速、易繁殖、产量高等特点著称,在我国已广泛种植,国内野生或栽培的杨属植物已经超过50种。但是由于该树种多年生长可能存在老化、降解等问题,对该属植物的鉴别中常规鉴别手段往往存在困难,因此有必要发展一种稳定而有效的鉴别手段来区分杨属物种。本研究选取河北地区主栽的15种杨树品种作为样本。首先,考察和对比四种常用的提取植物基因组DNA的方法,找到一个最适用于杨属植物的,以便于DNA条形码技术的后续实验的进行。其次,利用DNA条形码技术(DNA Barcoding),选取鉴定效率较高的DNA条形码片段(ITS2, matK, rbcL)及相应的PCR扩增通用体系,对提取的杨树基因组DNA进行扩增、测序和序列拼接。最后,比较3条候选序列的扩增及测序效率,利用Distance方法评估3条候选序列的物种鉴定效率,基于MEGA5计算所选择的十五种常见的杨属植物的ITS2和matK片段的K2P遗传距离,构建NJ树,进而评估条形码鉴定效率。实验表明,序列组合ITS2+matK对15种常见杨属植物在物种水平的鉴定效率为100%,而ITS2, rbcL, matK, matK+rbcL的鉴定效率分别为50%,17.9%,50%,57.1%。因此,ITS2+matK能够被当作区分和鉴别杨属植物的潜在条形码组合使用。
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