拟南芥CAP1抑制子基因的图位克隆

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拟南芥CAP1([Ca2+]cyt-associated protein kinase)是类受体蛋白激酶CrRLK1L亚家族的一个成员。它参与到了根毛细胞极性生长发育的调控,推测它可能通过调控胞质中 NH4+的稳态平衡,影响胞质中钙及活性氧分布,从而调节根毛发育。为了更好的解释 CAP1在铵调节根毛发育的信号通路中功能,我们筛选了 CAP1的抑制子,得到了一系列根毛生长得到恢复的突变体,命名为scp(suppressor ofcap1)。  经过 scp回交的表型分析和统计,确定其中 S61是单基因控制的隐性突变体,S61的根毛长度能够部分恢复 cap1的表型缺陷,并且生长状况稳定,这表明 S61可能参与了感知铵信号调控根毛发育信号传递,为了弄清 S61的工作机制,我们对其进行图位克隆和初步的功能分析。  通过将 S61与 Ler进行杂交构建图位克隆群体,经过粗定位和细定位,突变基因定位在3号染色体的下端。虽然3号染色体下端的交换率偏低,但是并没能确定突变位点可能的区间范围。因此在进行图位克隆的过程中,我们又将S61进行了全基因组重测序,通过对测序结果的分析,我们选择4个可能与CAP1功能相关的基因(At3G593xx,At3G631xx,At3G579xx,At3G620xx)进行下一步的功能分析。通过构建超表达载体转化 S61和 WT,同时将这4个基因突变,体与cap1杂交,拟通过对后代的分析来初步确定CAP1的抑制子。  综上,通过粗定位和细定位分析以及测序比对分析,目前已经将 CAP1的抑制子 S61定位于3号染色体的下端,初步锁定到4个基因编码的蛋白,初步的遗传分析和基因克隆已经完成,为后续顺利确定抑制子和研究其功能奠定了重要的基石。
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