改革开放三十多年来，我国的经济实力、整体生产力迅速提高，区域经济结构得到快速调整，特别是区域产业结构升级优化取得初步成效，但值得注意的是现阶段区域产业结构并不能与快速的经济发展水平相适应，不合理的区域产业结构已成为制约我国区域经济协调发展的最大障碍。当前政府已将如何优化我国区域产业结构作为国民经济和社会发展的一个战略性问题来对待，通过各种途径来寻求解决这个问题的办法。如何优化区域产业结构，发挥政府的主导作用，就必须确定区域产业结构优化升级的具体影响因素及其作用机制，并根据相关影响因素的作用效果制定相应的政策措施，将政策的外生力量有效地转变为其内生的优化作用机制，使得区域产业结构得以优化升级，真正实现我国经济的持续健康快速发展。在本文中，笔者首先回顾和阐述了区域产业结构优化理论，并在此基础上确定本文所要研究的影响因素，从产业政策、资源坏境、经济发展三个方面对区域产业结构优化的影响因素进行整理归纳，从理论上讨论了各影响因素对区域产业结构优化升级的作用机制，为实证研究提供了理论基础。通过运用分位数回归与面板数据回归估计结果进行对比，深入分析了不同影响因素与区域产业结构优存在的关系。实证结果表明，从影响因素的整体考察，主导产业、对外开放程度以及技术进步是区域产业结构优化升级的强效因素，资源利用效率以及市场化水平则为弱效因素。从影响因素的区域考察，主导产业、对外开放程度因素对东部产业结构优化度较高地区的影响力最强；资源利用效率对各区域的影响大小比较均衡；技术进步和市场化水平对中西部这些产业结构优化度较低地区的促进作用较为明显。在明晰问题和实证检验的基础上，对区域产业结构的优化升级进行了政策设计。主要包括：提升地区主导产业层次，优化区域产业布局；降低能源消耗，大力发展新兴现代服务业；扩大对外开放力度，实施中西部向西开放战略；提高自主创新能力，加大中西部科技投入力度；提高中西部市场化水平，实现区域资源合理配置。