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本研究用Tizol试剂直接从尿囊液中抽提病毒核酸,参考已报道的IBV- Beaudette核衣壳基因,自行设计—对引物,以IBV—N毒株(肾型)、ZJ971 毒株(腺胃型)和一个参考疫苗毒株H52为模板,用RT-PCR扩增它们的核衣 壳基因,将扩增得到的cDNA克隆入pBluescript SK载体中。用Lasefgene analysiS软件分析它们的核苷酸和推导的氨基酸序列。在此基础上,把ZJ971 毒株核衣壳基因克隆到pBV220表达载体,利用大肠杆菌进行原核表达,并 用Western-blotting检测。结果显示: ZJ971毒株、N毒株、H52毒株的核衣壳基因ORF全长都为1230个核苷 酸,均编码一条409个氨基酸组成的多肽。 腺胃病变型IBV-ZJ971毒株与其他各血清型IBV的核昔酸同源性在 87.0%—98.6%之间,氨基酸同源性在91.0%一98.1%之间。171位氨基酸突 变导致这一区域的亲水性大为增强,但283位氨基酸突变导致邻近的282位 亲水性下降,使其最大疏水峰由 197位移到282位。系统进化分析表明 ZJ971 毒株与DI 466、Cu/TZ毒株的亲缘关系较近,它们可能有共同的祖先。 肾病变型IBV-N毒株与其他各血清型IBV的核苷酸同源性均不高(86.6% —87.4%),氨基酸同源性在90.5-91.7%之间。其中189-190、223、236、286、 334-336位氨基酸的突变使上述5个区域的亲水性明显下降,240、301位氨 基酸的突变使这两个区域的亲水性稍有上升,整个蛋白的平均亲水值比其 它IBV小。系统进化分析表明N毒株与其它毒株(包括肾病变型Gray)的亲 缘关系均较远,处于相对独立的一支。 综合上述结果进一步从核衣壳蛋白基因角度证实 ZJ971 毒株、N毒株 是不同于其它各型IBV的新的变异株。 Western-blotting 只在重组表达菌样品中检测出一条约45kD的特异性蛋 白条带,与预期的蛋白分子量大小一致,表明 IBV-ZJ97毒株的核衣壳蛋 白确实在大肠杆菌中获得了高效表达,表达的核衣壳蛋白具有一定的金免疫 反应性,为进一步研究和开发IBV基因工程苗奠定基础。