不同物种脑中miRNA的克隆及miRNA与物种进化关系初步探讨

来源 :暨南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mikelee
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:利用本实验室改良的miRNA克隆方法及检测方法,我们从鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲中分别选取罗非鱼(Oreochromis nilotica)、蟾蜍(Xenopus laevis)、巴西龟(Trachemysscripta elegans)、家鸡(Gallus gallus)四种动物的脑为实验材料,丰富物种的miRNA数据库,并初步探讨miRNA在物种进化中的作用,为研究物种的进化提供新的思路和方法。方法:通过Trizol一步法提取四种动物脑中的总RNA,接着用PEG纯化其中的小分子RNA,再经过poly(A)连尾反应在小RNA的3’端连接上一段poly(A),然后在5’端连上adaptor,用Oligo(dT)primer将连接好的小RNA进行反转录,用根据adaptor和Oligo(dT)primer设计的引物来扩增小RNA,扩增后的小RNA进行胶回收后连接到T载体上,转化TOP10大肠杆菌后挑取阳性克隆进行测序,得到的序列再经过生物信息学的分析后确定是否为miRNA。鉴定出miRNA后,设计其特异性引物利用加尾RT-PCR对其表达进行初步分析。结果:1、利用本实验室改良的miRNA克隆方法,成功从罗非鱼、蟾蜍、巴西龟、家鸡中共克隆到8条长度为15-30bp的小RNA,经过Blast比对,二级结构的分析后确认,分别从罗非鱼、蟾蜍、家鸡中各克隆到1条miRNA候选序列,由于没有龟的全基因组序列及已发表的miRNA序列,因此,我们无法对巴西龟中的克隆所得的序列进行分析,但是从巴西龟中克隆到的序列与罗非鱼中获得的序列是相同的。2、将得到3条miRNA,设计其引物用加尾RT-PCR法对它们在这四种物种中的表达进行分析,结果表明这3条miRNA候选序列在这四种物种中的表达存在差异。3、将得到的3条miRNA候选序列序列与已知功能的miRNA序列进行同源性比对,发现这3条miRNA候选序列与物种的生长发育及新陈代谢相关。结论:miRNAs在不同分类地位的物种中具有相当的保守性,同时miRNAs在不同的物种中有不同的表达分析及功能预测结果表明miRNA可能是促进物种发生突变、推动物种进化主要动力之一。功能预测的结果显示,miRNAs在物种进化的过程中同样也在进化,可能是指导物种进化方向的重要因素之一。
其他文献
当前高校《 政治经济学》 课程教学存在理论理解难、 忽视社会主义部分教学、 教学特色不明显的特性.基 于互联网技术运用于教学的优势和局限性, 应进行“ 互联网+课堂” 的教
自2009年3月起,发端于墨西哥的甲型H1N1流感(以下简称“甲流”)疫情迅速向各国蔓延,已覆盖全球160余个国家和地区。我国卫生部办公厅印发的《甲型H1N1流感诊疗方案(2009年第3版)》^
本文把贺兰山地区的水资源蒸发和径流的相关资料作为研究的切入点,运用水文分析方法研究了贺兰山地区的水土流失、土地沙化、植被退缩等生态环境问题。