黄瓜单性结实QTL精细定位及候选基因表达验证

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黄瓜是世界范围内广泛栽培的重要蔬菜作物之一。具有强单性结实性的黄瓜品种在不利于授粉受精的生长环境中也可以获得稳定的结实率,保证产量,而且单性结实的黄瓜果实无籽,口感较好。因此,探明黄瓜单性结实的分子遗传机制是创新黄瓜单性结实种质、培育强单性结实性黄瓜新品种的必要基础。本研究以单性结实性具有明显差异的两个黄瓜品系(‘ZK’:弱单性结实品系;‘BY’:强单性结实品系)的F2群体为作图群体,利用90个在亲本间有多态性的SSR标记构建了一张黄瓜遗传连锁图谱,利用此图谱对黄瓜单性结实主效QTL进行了初步定位;对以弱单性结实的亲本为轮回亲本的回交后代BC1、BC2和BC3群体进行了重组株的筛选;对双亲进行了重测序并基于重测序结果在初步定位得到的主效QTL区间内发掘SNP和InDel位点,开发出相应标记后以BC3重组株为作图群体构建物理遗传图谱,完成黄瓜单性结实QTL的精细定位。对精细定位主效QTL区间内的候选基因在3种激素处理和不同黄瓜品系的果实中进行qRT-PCR表达验证。主要研究结果如下:1.利用SSR标记构建的遗传连锁图包含7个连锁群,图谱总长为652 cM。经过初步定位获得3个与黄瓜单性结实相关的QTLs,分别位于Chr2、Chr5和Chr7上,命名为par2、par5和par7,其中par7的LOD值达到7.9且高于另外两个QTL,而且其遗传贡献率达到13.9%,因此,选择其作为进一步进行精细定位的QTL。par7两端的SSR标记是SSR22643和SSR19437,区间大小为3.49Mb;2.构建了以’ZK’为轮回亲本的BC3回交群体,利用par7初步定位QTL两端标记筛选到了 3个BC3重组株家系,利用InDels和SNPs对70株BC3进行了基因分型,最终将目标QTL定位至60.4 kb区间范围内,物理位置介于5121054和5181487之间,区间内共有14个基因,功能注释涉及三角状五肽重复蛋白(PPR)、MYB家族转录因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、甲基酯酶、ACC氧化酶和2-氧戊二酸双加氧酶等;3.用CPPU、NAA、GA4+7处理的’ZK’和’BY’未授粉处理的黄瓜果实都正常膨大,‘ZK’未授粉处理的果实产生化瓜现象。在这几种激素处理和不同单性结实能力的黄瓜品系中,C7G074870.1在开花后0-4天内呈现出了规律性表达,与单性结实的关系为负调,该基因是一个MYB家族转录因子。初步结论认为该基因可能是控制黄瓜单性结实的关键基因。
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