20世纪90年代初,员工股票期权传入我国,为越来越多的公司所采用,成为员工收入的重要部分。实践证明,税收政策是影响员工股票期权顺利实施的重要因素。目前我国相关的税收政策存在很多漏洞,税负显失公平,为促进股票期权的良性发展,相关的税收政策亟待完善。本文先运用模型讨论员工股票期权税收政策的效用,然后结合案例,分析我国员工股票期权税负的状态,揭示了我国员工股票期权税负显失公平,主要表现在三个方面：不同纳税人同一股票期权行为下的税收负担,同一纳税人不同股票期权行为下的税收负担,同一纳税人不同的股权激励方式下的税收负担。造成这种显失的直接原因是相关税收政策存在缺陷,深层次的原因是我国分类个人所得课征模式和相关的配套法规不健全。从与其他国家(地区)的比较中,得出启示：我国股票期权适合采用分类管理、适度优惠的税收政策。完善员工股票期权政策的方案应该从三个层面加以考虑：员工股票期权税收政策层面,个人所得课税制度层面,税收制度环境的调和层面。员工股票期权具体税收政策层面：以公平原则和效率原则为指导,采取制定系统化的法规、分类管理等措施,以达到：对高管人员与普通员工的股票期权等区别对待,对上市公司与非上市公司的股票期权等公平对待的目标。个人所得课税制度层面：促进个人所得税制向分类综合模式转化；促进代扣代缴制向自行申报制转化。税收制度环境的调和层面：增强纳税人意识；与其他法律法规相协调等。经过这三个层面的完善,以期能实现我国员工股票期权税负的公平,促进这一激励手段在我国的健康发展。