中药栀子为茜草科(Rubiaceae)植物栀Gardenia jasminoides Ellis的干燥成熟果实,此药开始记载于《神农本草经》,应用较广,性寒,味苦；归心、肺、三焦经,具有泻火除烦、黄疸尿赤、凉血解毒、清热、外用消肿止痛之功效，用于血热吐衄、血淋涩痛、热病心烦、目赤肿痛、火毒疮疡等证。主产于江西、湖北、四川、重庆、浙江、福建、湖南等省。而巴中是四川栀子的主流产区，江津是重庆栀子的主流产区。都系传统中药道地药材，这在《中草药彩色图谱》中有详实的叙述。根据现代药理研究证实，栀子具有利胆、保肝、解热、抗病原微生物、镇痛、抗炎、镇静等作用。ISSR标记（inter-simple sequence repeats）是由Zietkiewicz等提出的一种标记技术，采用17～22个碱基的重复锚定引物扩增重复序列之间的片段[6]。ISSR标记使用了比RAPD引物更长的引物，克服了RAPD标记稳定性和重复性差等致命缺点，操作非常简单，重复性良好，多态性比较丰富。DNA分子标记是近年来发展起来的一种高科技分子生物学新技术,它是本着以生物个体间不同遗传物质内核苷酸序列差异为基础的遗传标记,因其能够从DNA水平直接反映了生物的遗传本质,与以往的生物化学、形态学和细胞学标记相比具有明显的优越性。从而,越来越广泛的应用在中药研究中。本课题组通过不断对巴中栀子进行研究，证实了其品质的优良和开发利用的确切价值，又考虑到近几年来关于栀子遗传多样性的研究中未见有针对于巴中、江津和纳溪产栀子ISSR的报道，所以本文对这3个不同产地5个系列的栀子的亲缘关系进行研究，并着重探索出巴中产栀子种质资源的遗传多样性，从而进一步完善巴中产栀子科学、规范、综合的品质评价体系及其品质研究。