转录组测序解析氨气对断奶仔猪肺组织结构和免疫相关基因表达的影响

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本试验的目的是通过RNA-seq测序技术解析不同浓度氨气对肺组织产生的损害,进而了解氨气损害肺组织和机体功能的分子作用机理。试验先将12头杜×长×大三元断奶仔猪分四组进行不同浓度氨气刺激试验,对照组CK无氨气处理(测得氨气浓度为5.31mg/m~3),试验组T1、T2和T3分别暴露在氨气浓度为22.77 mg/m~3、45.54 mg/m~3和68.30mg/m~3的空气中,每天持续刺激8 h。其中适应期3 d,试验期11 d,于试验第15 d早晨空腹屠宰取肺组织,制作切片并在显微镜下观察肺组织结构变化。并将采集的肺组织样品RNA提取后进行转录组测序分析。结果显示:4组仔猪肺组织12个样品筛选出2529个差异表达基因,涉及视黄醇代谢、ECM-受体相互作用和细胞粘附分子(CAMs)等与肺组织结构相关的通路以及吞噬体、细胞因子-细胞因子受体相互作用、生成Ig A肠免疫网络、JAK-stat信号通路和造血细胞系等与免疫相关的通路。22.77 mg/m~3以上浓度氨气刺激下调了视黄醇代谢通路中CPY家族基因CYP1A、CYP2和CYP1A1的表达,抑制了肺组织上皮细胞中视黄醛向视黄醇和视黄酸转化的途径,进而对肺泡、肺组织和气血屏障的产生损伤。同时,氨气刺激影响了细胞外基质中蛋白(COL2A1、COL11A1、COL11A2、COL26A1及CTGF)的生成,阻碍了肺组织的修复,并使细胞基质沉积增加导致肺泡隔增厚。补体相关基因(C9、CFB、C1r以及C3)、抵抗肿瘤相关的基因(LAG3、DDX家族)、干扰素相关类的基因(IFIT1、MX2、IRF7)、白细胞介素(IL7R)以及OASL、LBP等大部分免疫相关基因在氨气刺激下基因表达上调,产生免疫应答以及炎症反应,但三个处理组间基因表达差异不显著(P>0.05)。基质金属酶MMP 7和MMP 20的表达上调也表明肺组织发生了炎症反应。肺组织结构相关基因CEACAM5、CPA4和Mucin16-like表达量随着氨气浓度升高而升高,68.30 mg/m~3浓度氨气对其影响最显著(P<0.05)。与免疫反应相关的基因中,氨气刺激使SCGB3A2、UNC93A、TREM2和SERPINB2表达量上调且68.30 mg/m~3时上调最显著,但下调了CD207和CTRP9表达量且45.54 mg/m~3时下调最显著(P<0.05)。结论:不同浓度氨气刺激导致断奶仔猪肺组织基因表达差异,从而破坏了肺组织的正常结构,影响了断奶仔猪的免疫功能。
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