在国家整体经济的运作与发展进程中,科技创新发挥着越来越大的作用,而高新技术企业领域作为本行业开展技术创新活动最为集中、最为活跃的地方,其具体发展状况与国家是否能够从整体上完善社会主义市场经济等有着极其重要的关系。在高新技术产业不断壮大的新形势下,各个国家都十分关注本国高新技术产业的发展,并采取诸多政策措施对其进行支持,税收作为政府部门的一种重要财政收入形式,其功能已经不仅仅局限于组织财政收入上,更多的是将其作为政府积极参与推动企业技术创新活动,调整产业结构与影响宏观经济的重要政策激励手段。我国应积极学习发达国家的先进经验,发挥好该产业在促进经济发展、引导产业向更好的方向进行转型的积极作用,增加政府税收激励政策对高新技术企业技术创新的力度,对税收激励政策的实施效果进行科学地评价,全面讨论其作用机制及影响,对下一步政策部门制定公共政策具有深远的意义。通过搜集和整理相关文献,总结高新技术企业相关税收理论和实证研究成果,首先从理论上分析了该行业技术创新税收政策的激励机制和效应,阐述税收优惠政策对技术创新的促进作用,并在已有的理论基础上,建立税收对高新技术企业发展的短期与中长期效应模型;其次,通过实证分析,比较各种税收优惠政策的影响效应,并研究在不同税种的优惠下,对高新技术产业现时与未来发展造成的影响,得出以增值税为主的流转税优惠与所得税优惠均可以促进高新技术企业现时与未来的发展,不同税种的优惠为企业带来的激励效应不同,对以增值税为主的流转税进行优惠可以有效地提高企业研发人员的占比,对所得税进行优惠可以较好地促进企业主动加大对研发的资金投入,整体看来,以增值税为主的流转税优惠对高新技术企业进行科技创新的激励作用更强;最后,通过上述理论分析和实证分析,提出了提高企业自主创新意识、转变税收优惠环节、规范企业所得税制度、加强企业纳税意识、提高流转税优惠、构建风险投资税收优惠政策以吸引投资等完善高新技术企业税收优惠政策的合理建议。