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目的：了解中国地区人乳头瘤病毒和EB病毒的流行病学特点,为食道癌的防治提供科学依据。探讨人乳头瘤病毒和EB病毒与食道癌是否具有疾病相关性。方法：我们收集了180份食管鳞状细胞癌标本和60份对照组食管组织标本。采用PCR方法通过HPV通用引物(可以检测16,18,31,33,35,52b和58型等常见型别)和HPV16型特异引物来检测HPV,同样采用PCR方法来检测EBV。使用已测序鉴定的HPV和EBV阳性核酸作为PCR反应的阳性对照,β-actin基因片段作为检验收集标本DNA质量的内部参照。不同组别之间检出率的差异通过χ2检验来比较,所有的统计学分析使用SPSS 11.5软件来完成。结果：使用β-actin特异性引物扩增基因片段来检测所提取的DNA的质量,结果180份食道癌标本和60份对照组标本全部扩增出β-actin特异性基因片段。使用通用引物对临床180份食道癌标本和60份对照组标本进行HPV的DNA检测,180份食道癌标本中,有119份为HPV阳性,HPV阳性率为66.1%,对照组HPV检出7例,阳性率为11.67%,病例组和对照组HPV检出率之间的差异有统计学意义(χ2=53.489,P=0.000)。对HPV通用引物检测阳性的标本,使用HPV16型特异引物进行检测,病例组119份HPV阳性标本中,40份为HPV16型阳性,阳性率为33.6%。对照组7份HPV阳性标本中,有2份为HPV16型阳性,病例组和对照组之间HPV16检出率的差异有统计学意义(χ2=11.121,P=0.001)。180份食道癌标本中,32份为EBV PCR阳性,阳性率为17.8%,对照组60份标本中,6份为EBV阳性,阳性率为10%。病例组和对照组之间的EBV阳性率没有统计学差异(χ2=2.043,P=0.153)。结论：结果表明HPV感染和食管鳞状细胞癌有疾病相关性,其中HPV16型在HPV感染中占据很大比例,可能是食管鳞状细胞癌主要的致病原。病例组和对照组之间的EBV阳性率没有统计学差异。而且在病例组32份EBV阳性标本中,其中有19份合并HPV感染,以上结果提示EBV可能不是食管鳞状细胞癌的致病原。