【摘 要】
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本文在蛋白质折叠的三个方面做了一些初步的研究.第一是要找到表示蛋白质三维组态的模型.第二是根据已建立的模型设计出模拟蛋白质折叠过程与预测蛋白质三维空间结构的算法.
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本文在蛋白质折叠的三个方面做了一些初步的研究.第一是要找到表示蛋白质三维组态的模型.第二是根据已建立的模型设计出模拟蛋白质折叠过程与预测蛋白质三维空间结构的算法.第三是如何提高这个算法的效率.本文所采用的蛋白质三维组态模型是HP三角格子模型,详细论述了HP三角格子模型的组成方式,表示方法,特征以及在计算机中的实现;在这个模型的基础之上,采用遗传算法在巨大的蛋白质三维组态空间中进行搜索,模拟蛋白质的折叠过程并找到自由能最小的蛋白质空间结构;利用粗粒度并行遗传算法提高计算效率,详细论述了采用这一并行算法进行计算的主要思想与关键技术;在已得到的数据基础之上,采用复杂网络模型应用两种方法建立了蛋白质折叠网络,对它做了一定的分析,尝试得出一些规律;阐述了所建立的复杂网络的结构与得到它的属性的计算步骤;最后总结了本论文所做的工作,并指出本课题领域有待于进一步研究的问题.
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