党的十八届四中全会对深化司法体制改革作出全面部署。结合当前我国检察工作实际,对基层检察院内设机构设置进行改革,有利于司法体制改革在检察环节的细化和深化。本文立足公共管理学相关理论,结合检察机关的权能配置,利用比较研究、案例研究等方法,辅以社会调查、访谈等方式,深入分析基层检察院内设机构存在的职权配置不合理、功能定位异化、职能交叉重复等问题,挖掘问题产生的深层次原因,论证了改革的必要性。近年来,部分省市的基层检察院纷纷探索,借鉴“大部制”改革思路,对原有内设机构进行重组和整合,积极寻求法律制度框架内的检察改革创新,在优化检察职能配置、科学设置内设机构等方面做出许多有益探索。本文通过对湖北、吉林、青海等省基层检察院“大部制”改革试点工作进行分析研究,在总结经验的同时,指出改革中亟待解决的问题。最后依据检察权能运行规则及配置规律,提出“大部制”视域下基层检察院内设机构改革所应遵循的确保检察权依法全面行使、强化监督制约、精简效能规范统一等基本原则,在此基础上,提出基层检察机关内部机构改革的基本思路,根据区域经济社会发展水平、案件受理量和人员编制数等情况因地制宜、因院制宜,设置了“紧凑模式”、“简约模式”和“专业模式”三种可供基层检察院推进内设机构改革参考的模式。