仔猪免疫性状QTL的部分染色体扫描

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本试验以8头大白公猪、29头大白母猪;2头长白公猪、6头长白母猪和3头松黑猪公猪、13头松黑母猪,为基础群组建的混合家系,选择子代个体共289头。20日龄和35日龄分别采血,测定并记录血液常规18项指标。选取31个微卫星位点进行PCR扩增(淘汰2个杂合度不高的标记),判定基因型,取得如下结果: 1.所有29个微卫星标记在三个品种中的平均等位基因数为3.2069,平均杂合度为0.4575,平均多态信息含量为0.3936。选择的微卫星标记在不同品种群体中信息含量和杂合度表现虽然不同,但可以满足连锁图谱构建和QTL定位的要求。 2.用CRIMAP软件进行资源家系群体1、4、6号染色体遗传连锁图谱的构建,3条染色体长度分别为220.2cM、285.8cM、309.0cM。与USDA-MARC图谱相比图谱较长,主要是标记间的间距变大,标记的排列顺序与USDA-MARC图谱一致。 3.用线性模型最小二乘法对免疫性状进行QTL区间定位,利用置换法(permutation)确定显著性阈值。达到了染色体显著水平的QTL:20日龄血液指标中,1号染色体上定位了2个QTL;4染色体上定位了9个QTL;6号染色体上定位10个QTL。35日龄血液指标中,1号染色体上定位了6个QTL;4号染色体上定位了6个QTL;6号染色体上定位6个QTL。此各种性状的QTL位置具有一定的规律性,相关比较紧密的性状往往定位在染色体上相同或邻近的区间内。这提示我们这些QTL之间可能存在一因多效或基因互作。
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