随着社会进步发展,宠物在人们日常生活中扮演越来越重要的角色,我国宠物市场规模也急剧扩张。宠物与人类共同生活,接触紧密。有研究表明,人类与伴侣动物的接触会潜移默化的改变彼此的肠道菌群,这也导致多重耐药菌株在人类和伴侣动物之间跨物种传播的可能性不断增加。因此伴侣动物在人兽共患病原传播和细菌耐药性交叉感染等相关问题的重要性日渐突出,是当前重要的兽医公共卫生学问题之一。围绕宠物人兽共患病原菌种类不清,以及耐药细菌背景不明的关键科学问题,本研究系统开展杭州部分地区（以浙江大学动物科学学院附属宠物医院为主）宠物肠道携带细菌、潜在人兽共患病原菌及其耐药性的调查研究。主要研究内容包括:（1）宠物肠道来源菌株的分离与鉴定;（2）宠物肠道来源大肠杆菌的耐药性分析和基因型研究;（3）宠物源沙门菌的耐药谱鉴定及其全基因组测序和生物信息学分析。1.宠物肠道来源菌株的分离鉴定:本研究于2018年3月-12月间收集的宠物肠道样品137份,其中猫源样品54份,来源于12种不同品种;犬源样品83份,来源于20种不同品种。共获得1003株分离株,经飞行质谱法和16s DNA测序鉴定,分离率最高的菌种为大肠杆菌（27.5%）、粪肠球菌（17.1%）以及奇异变形杆菌（13.9%）;而且在不同条件下,例如不同健康状况,不同年龄等,分离株的组成比例是相似的,说明宠物肠道携带的优势菌群是较为稳定的。2.宠物肠道来源大肠杆菌的耐药性分析和基因型研究:本研究共分离得到276株大肠杆菌,并对分离株进行了 8种抗生素药物的最小抑菌浓度检测试验。结果表明宠物源大肠杆菌分离株对萘啶酸（60.5%）、复方新诺明（76.1%）、阿莫西林克拉维酸钾（62.3%）等药物高度耐药,对多粘菌素（6.9%）、替莫西林（12.3%）等新药物相对敏感;且菌株耐药性与宠物种类、宠物健康状况、抗生素使用史具有一定的相关性。宠物犬肠道分离菌、患有肠道疾病的宠物来源菌株、曾服用抗生素的宠物来源菌株的耐药性要相对更高。大肠杆菌的多位点序列分型结果显示,杭州地区分离株具有高度的多样性,共获得83种基因序列型（ST型）,其中包括部分与人高度相关的ST型（ST410、ST131）。大肠杆菌的宿主特异性与菌株的ST型有一定的相关性,部分ST型由犬或猫特异性携带,部分ST型由两种宠物共同携带。菌株耐药性与ST型之间存在相关性,不同的ST型之间耐药率有较大的差异。但大肠杆菌耐药分布具有多态性,分离株的基因型能代表耐药性的趋势,但耐药性还受质粒等其他因素的影响。3.沙门菌的耐药性以及全基因组分析:本研究共分离得到26株沙门菌。对宠物源沙门菌进行全基因组测序、生物信息学分析以及耐药性检测,发现沙门菌分成差异显著的两组。第一组共22株,来源于肠道疾病宠物样品,均为都柏林沙门菌,ST型均为ST10,携带有IncFⅡs、IncA/C2以及IncX1质粒,多数对10种药物耐受。第二组共4株,来源于健康犬宠物样品,均为鼠伤寒沙门菌,ST型均为ST19,携带IncFⅠBs、IncFⅡs、IncⅠ1以及IncQ1质粒,分离株的耐药性相对较低,耐药数量在2～5之间。对耐药基因的统计分析表明,沙门菌耐药表型与耐药基因的携带情况具有高度的对应性。本研究发现宠物源大肠杆菌和沙门菌均有较高的耐药性,且使用抗生素会较显著的提高肠道菌的耐药性,提示临床应用抗生素时需要更加谨慎。本研究对于摸清杭州部分地区宠物携带病原谱系、流行株遗传背景与耐药谱等信息具有一定参考意义,提示宠物兽医临床合理用药重要性,同时需要重视宠物来源人兽共患病原菌所带来的潜在风险。