马传贫病毒弱毒株前病毒gp90基因在马体内的变异分析

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Melanzpl1
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为了研究gp90基因在我国马传贫驴白细胞弱毒疫苗株致弱过程中的变异规律,本实验以EIAV强毒辽宁株(EIAV-L)感染一匹健康马,此马发病死后,采集脾脏组织以nested-PCR扩增前病毒gp90基因片段;以驴强毒株(EIAV-D)感染一匹健康马,同时以马传染性贫血驴白细胞弱毒疫苗株(EIAV-DLA)分别接种两匹健康马,从不同时期(15、45、75、105、135d)马外周血单核细胞中以nested-PCR扩增前病毒gp90基因片段。将所得的100个EIAV-DLAgp90的克隆株与EIAV-L的gp90核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行分析比较发现,核苷酸同源性最低为96.1%,最高为97.4%,编码的氨基酸同源性最低为91.6%,最高为95.8%。每个时期核苷酸序列平均差异率分别是3.295%、3.145%、3.3%、3.185%、3.645%,总平均差异率为3.314%。每个时期氨基酸序列平均差异率分别是5.52%、5.51%、5.565%、5.56%、6.365%,总平均差异率为5.704%。变异有明显的规律,变异主要包括点突变和缺失,从单个马、单个时期来分析,突变的氨基酸位点非常保守,且变异的趋势高度一致。但是纵向比较两匹免疫马五个时期gp90基因编码的氨基酸序列,每个时期的突变的氨基酸位点又与其他时期不完全相同。EIAV-L的gp90基因编码的氨基酸有20个N-连接糖基化位点,EIAV-DLA的gp90基因编码的氨基酸序列上,N-连接糖基化位点数目平均是17.2个,其中有11个N-连接糖基化位点是高度保守的,在主要中和位点(PND)上,有3处不稳定的突变。EIAV-DLA株与EIAV-D株的gp90序列的比较结果显示:来源于同一免疫马体内的不同克隆株之间的gp90基因存在有密切的遗传关系,不同马体内来源的gp90基因克隆株之间存在一定的差异,这种差异可能与EIAV-DLA所处的不同的宿主环境有关。EIAV-DLA株的gp90基因在马体内种群较EIAV-D株的种群均一。EIAV-D株gp90基因在马体内的变异随着时间的推移较EIAV-DLA株大。EIAV-DLA株的gp90基因在马体内的进化速率较EIAV-D株慢。免疫选择压力在EIAV的gp90基因变异中不起主要作用。
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