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本研究用从质粒pDsRed2-1中分离的红色荧光蛋白基因DsRed2构建了原核表达载体pGEX4T-1-DsRed2，进行了原核表达，并对目的蛋白的生物信息进行了分析，结果表明: 1、从质粒pDsRed2-1中分离的含有红色荧光蛋白基因DsRed2的目标DNA片段，序列长度为680bp，含有678bp构成的开放阅读框(ORF)。与参考序列Ref_DsRed2-DNA相比，所克隆的含有目的基因DsRed2的DNA片段在其ORF内，从起始密码子的第1个碱基起，下游第537个碱基由C突变为T，使第179个密码子从TCC(UCC)变为TCT(UCU)，两者的序列一致性为99.85％。克隆的含有目的基因DsRed2的DNA片段在其ORF内存在的单碱基突变属于同义突变，所编码的目的蛋白氨基酸序列不变，序列一致性为100％。 2、目的基因DsRed2编码由225个氨基酸组成的蛋白RFP2;该蛋白属于荧光蛋白超级家族。该蛋白无信号肽，不涉及合成后的转运。 3、RFP2蛋白氨基酸序列包含5个疏水区和5个亲水区，前者都比较小、且由弱亲水部分所构成，而后者都很大、且由强亲水部分所构成;该蛋白亲水性氨基酸残基数量是疏水性氨基酸残基数量的2.2倍，其总亲疏水性值为-129.9;该蛋白的氨基酸序列经高级折叠形成的疏水内核较小，疏水性氨基酸残基被裸露于外部的亲水性氨基酸残基所包埋、大部分序列构成了亲水表面、形成亲水的蛋白颗粒。 4、利用目标DNA片段构建的DsRed2的原核表达载体pGEX4T-1-DsRed2，目的基因DsRed2正确插入到原核表达载体pGEX4T-1的GST标签基因的下游，目的基因DsRed2与GST标签基因形成无移码突变的可连续阅读的开放阅读框，两者构成GST-DsRed2融合基因。 5、DsRed2基因不仅在表达菌株BL21(DE3)中能够表达，而且在克隆菌株DH5α中也能够表达。在BL21(DE3)中RFP2的表达量，在1～5h范围内，随诱导时间的延长而迅速增加，此后增加不明显;诱导3h时，目的蛋白的积累量已非常充足。 6、RFP2在细胞中有一定的可溶性，但大部分RFP2以难溶性包涵体形式存在，且能正常显示出红色荧光。RFP2为单体蛋白，无需形成多聚体且无需特殊光源激发，在自然光下即可呈现出红色荧光。