ATP结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白是目前已知最大、功能最广泛的转运蛋白家族。多向耐药性(pleiotropic drug resistance,PDR)蛋白是该家族中仅存于植物和真菌中的一个亚族。该基因家族可能通过水解ATP释放能量,引起蛋白质构象变化,参与包括人参皂苷在内的植物次生代谢产物的跨膜转运及胁迫反应等功能。该论文在前期克隆到人参PgPDR2基因全长cDNA基础上,选择应用生物信息学分析计算机软件,解析及预测该基因及编码蛋白质结构与功能。基于GenBank核酸数据库进行同源性比较、构建系统发育进化树、解析PgPDR2氨基酸化学组成、理化性质、二级结构、三级结构。结果表明,人参PgPDR2基因与植物PDR基因具有较高的同源性。人参PgPDR2蛋白稳定,无信号肽,含有两个跨膜结构域,含有磷酸化位点,定位于细胞膜上,保守区域包含ATP结合位点、ABC标记(ABC transporter signature).Walker A及WalkerB结构域等。PgPDR2蛋白二级结构包括α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲,三级结构呈倒V型。PgPDR2核酸、蛋白质结构特点推定其可能具有人参皂苷的转运蛋白的功能,并在植物次生代谢产物转运中发挥重要作用。人参PgPDR2基因的生物信息学分析结果,为对其功能的深入研究提供了重要的理论依据。