建立新型农村合作医疗制度，是符合中国国情的，一个主动去解决农民困难的问题。提高农民的健康，缓解农村贫困，由疾病引起贫困，城市和农村的医疗保健系统，实现全面小康社会具有重要意义。新型农村合作医疗制度的实质是一项长期的农民医疗互助共济制度。自2003年国家开始推行新型农村合作医疗十年来，新农合运行机制得到初步完善。参保人群逐年增加，保险报销比例提高，保险项目也增加了，农村居民对新农合有了基本了解，并成为了合作医疗政策的受益者。但在这十年实践过程中，也暴露出了一些问题，其中最急需改进的就是医疗卫生资源分配不均的问题。本文以此为问题的切入点，通过对江西省X县新农合运作的实地调研，选取了比较有典型意义的农村地区，进行了实地调研分析，拿到不少真实的第一手资料。通过对资料的分析和对农民的访谈调查，发现在县，乡镇，村这三级医疗机构对医疗卫生资源配置有明显差距。而新农合医疗卫生服务的资源配置不合理就会直接导致参合率下降，服务质量更差等一系列的循环问题，这会使我国的医疗体系不能全面覆盖全部需要的人群了。本文就所研究的问题给了一些建议，比如提高基层卫生服务人员工资，提高医疗资源利用率等等。希望给江西新型农村合作医疗的实施以一些建设性的意见。