从2012年09月至2013年08月，对闽南地区的三个地级市（泉州、厦门和漳州）做了木材腐朽菌的野外调查和样品采集，采集的地点细化到市区的公园、街道，郊区的森林公园、山丘等。三个地区共选取了25个采样点并采集了227个样品，其中泉州11个点96个样、厦门9个点113个样、漳州5个点18个样。经过形态特征鉴定和ITS rDNA序列分析，146个样品已经鉴定到属种，其中泉州59个、厦门72个、漳州15个。这些已鉴定的样品除了1个子囊菌（炭角菌Xylaria regalis），其他均为担子菌。鉴定出的担子菌分布在7个目中，大部分属于多孔菌目和伞菌目，还有锈革菌目、木耳目、红菇目等。研究结果表明，大部分的样品属于腐生菌类群，少数的病原菌也时有发现，如云芝(Trametes versicolor)，Inonotus porrectus，有害木层孔菌(Phellinus noxius)。由于闽南地区地处亚热带季风气候区且位于东海之滨，大部分的均能生长良好，鉴于这样的情况，木材腐朽菌对木材的危害和侵染有待我们进行更深入的研究。同时本研究也在前人研究的基础上，探讨了福建闽南地区灵芝属的系统发育关系。