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大豆[Glycine Max（L.）Merr.]是我国非常重要的粮油兼用作物,其产量的高低与大多数农艺性状有着间接或者直接联系,如:株高、主茎节数、分枝等。目前大豆相比于水稻、小麦等高产作物,产量偏低,育种进程相对缓慢。而借助分子标记与目标性状间的关联,深入剖析性状表型变异的遗传基础,对产量相关性状进行基因定位,不仅为分子标记辅助选择和基因克隆奠定基础,而且大大提高大豆高产育种的效率。大豆微核心种质（minicorecollection）代表了我国2.3万余份栽培大豆种质资源大约63.5%的遗传多样性,是用于大豆基因挖掘和品种改良的优异材料。本研究以224份大豆微核心种质为试验材料,并对表型数据进行了描述性统计分析和方差分析,探讨了产量相关性状之间的相互关系。利用覆盖全基因组1749个单核苷酸多态性（SNP）标记,对株高、主茎节数、分枝、茎粗、平均节间长和有效荚数等6个性状进行全基因组关联分析。在此基础上,对两种模型共同定位到的产量相关性状SNP位点进行优异等位变异的挖掘以及优异种质的筛选。通过对大豆产量相关性状紧密关联的SNPs进行全基因组的鉴定研究,为下一步进行大豆产量相关候选基因的筛选和功能标记辅助育种提供了新的参考。本试验主要研究结果如下:1、大豆微核心种质群体的株高、主茎节数、分枝、茎粗、平均节间长和有效荚数等6个产量相关性状间均变幅较大,各表型变异系数在16.96%-45.55%之间。通过方差分析发现品种间存在极显著差异。并且各性状的广义遗传率都较高,均在78.18%以上。在简单相关性分析中,除平均节间长与分枝和有效荚数不相关外,其它性状两两之间都达到极显著相关。其中株高和主茎节数的相关系数最大,达到了 0.885。2、在P<10-3（-1gP>3.00）条件下,运用GLM模型和MLM模型对6个性状共同关联到36个SNPs,其中株高共同关联到13个SNPs位点,分别位于2、6、8、10、11、15和18号染色体上;主茎节数关联到4个位点,分别位于5、6、10和11号染色体上;分枝关联到7个位点,分别位于2、6、7、8、13和18号染色体上;茎粗关联到9个位点,分别位于2、5、10、14、15和18号染色体上;平均节间长关联到1个位点,位于18号染色体上;有效荚数关联的2个位点都位于7号染色体上。位于10染色体上的标记Map-1899在株高、主茎节数、茎粗三个性状两种模型以及平均节间长GLM模型中都拥有最高的P值。3、分析GLM模型和MLM模型共同关联到的SNPs位点,筛选到36个拥有增效或者减效效应的优异等位变异。其中,株高筛选到6个增效等位变异,7个减效等位变异;主茎节数筛选到1个增效等位变异,3个减效等位变异;分枝筛选到4个增效等位变异,3个减效等位变异;茎粗筛选到7个增效等位变异,2个减效等位变异;平均节间长只筛选到1个增效等位变异（Gm184309759-A）;有效荚数筛选到1个增效等位变异,1个减效等位变异。然后探究优异等位变异在6个性状各20份极端材料（高或低）中的分布情况。结果表明,L92品种在株高、主茎节数、茎粗和平均节间长等4个性状中含有的增效优异等位变异均最多;在减效优异等位变异分布中,L5在株高、主茎节数和茎粗等3个性状中数量最多,L20在主茎节数、分枝和茎粗中数量最多。