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普通野生稻是亚洲栽培稻的祖先种,确定普通野生稻的遗传多样性中心对探讨栽培稻的起源进化研究和野生稻保护均具有重要意义。本研究中利用分布于12条染色体的28个SSR位点,对来自全国6个省(区)20个居群的628份普通野生稻进行分子标记,研究其遗传多样性。结果如下: 1.在28个微卫星位点中共检测到等位基因406个。位点RM253、RM336、RM333、RM229的A、Ae、He、Ho和Ⅰ均较高,能更好的检测居群的遗传多样性。在20个居群按纬度从低到高排列的香农指数(Ⅰ)、平均期望杂合度(He)和实际观察杂合度(Ho)趋势中,除几个特殊居群外,北纬19.5°-23.5°之间的居群的遗传多样性比较高,即海南北部和两广北回归线以南的地区应为中国普通野生稻的遗传多样性中心,并推测此地区也可能为栽培稻的起源中心。 2.通过聚类分析和主坐标分析(PCO),可将20个普通野生稻居群大致分为4个区域:(1)海南南部居群之间遗传关系较近,但各居群间的基因交流受到一定的影响;(2)海南北部和两广南部北回归线以南的居群不仅遗传多样性较高,而且遗传关系非常近,是华南的遗传多样性中心;(3)湖南和江西的北缘居群及与其靠近的华南北部居群与华南的中心居群之间存在着一定的遗传隔离;(4)两广中北部的居群是遗传多样性逐渐降低的地区,此地区是中心居群与北缘居群的过渡地区,呈现一定的遗传分化状态。 3.分省(区)的遗传多样性比较结果表明,广西、广东、海南三省(区)是普通野生稻遗传多样性较高的地区,而湖南、江西、福建等省的普通野生稻的遗传多样性则较低。遗传关系分析结果表明,海南、广西、广东3省(区)群体的亲缘关系较近,湖南和江西2个群体的亲缘关系较近,而福建群体与其他5省(区)群体之间形成了一定的遗传分化。 4.由于RM20A位点在同一普通野生稻材料中出现的谱带数多于2,可能存在两个以上的结合位点,即引物可能是非特异性的。为了进一步阐明该引物出现异常的原因,选取50份栽培稻材料进行研究。结果表明栽培稻也出现了2个以上的位点,但其遗传变异水平明显低于普通野生稻材料。