在分析、综合调查珠江西江河口1988年以来有关水质资料的基础上，2000年5月至2002年2月针对珠江西江河口的具体状况，著重开展了二个方面的观测研究：(1)水生态系统中氮营养盐变化与赤潮发生的关联性；(2)水浮莲生物污染与赤潮发生的关联性；(3)水体叶绿素含量、化学需氧量、悬浮固体量与赤潮发生的关联性。结果表明：(1)珠江西江河口由于受携带陆源污染物的珠江淡水流强烈影响，浮游藻类生长的磷素营养不够成限制因子，因此，氮营养盐动态变化(尤其铵氮N)能够表征浮游藻类的消长过程；(2)来自内陆河流的水浮莲，到达盐度季节变化幅度较大的珠江西江河口水域后，大量死亡腐败分解而造成有机污染，可周期性助长赤潮的发生；(3)在珠江西江河口水域采用水体叶绿素含量为监测赤潮浮游植物的直接指标，同时，选择水体悬浮固体含量和化学需氧量为间接指标，不仅能够有效地观察和预测当地赤潮的发生，而且该方法简便、易行，可以较好地满足当地渔农自我快速监测和预防赤潮的实际需要。珠江西江河口赤潮预指数叶绿素为(OD664／OD665)在1.40～4.60，COD在2.5～3.0mg／L；赤潮暴发前，水体中的铵氮受季侯风影响而物理性聚集在某一水域，珠江西江河口半封闭水体铵氮含量出现较高的测量值，铵氮含量分析是河口赤潮生物演变方向的最佳指示参数；。