核桃(J. regia L.)是核桃属中最具栽培价值的树种之一,众所周知栽培良种是发挥优异特性的有效途径,因此培育新品种成为十分重要的研究领域,但是,核桃作为多年生木本植物,育种周期很长,由于育种园的更替和变迁、试验记录遗失等各种原因,常常会造成亲本信息缺失的现象,给优良品种的知识产权保护、苗木甄别和育种谱系建立带来困难,也给深入认识优良性状的形成机制和遗传规律带来不便。因此,寻找简便、高效和快捷的核桃亲子鉴定方法显得尤为必要和迫切。本研究采用8个稳定表达的坚果表型性状、10对具稳定多态性的单位点SSR引物,和8对AFLP引物对‘鲁果2号’及其6个可能亲本(‘香玲’、‘元丰’、‘鲁香’、‘丰辉’、‘岱丰’和‘上宋6号’)进行亲子关系分析,并以‘Slz-40’和已知亲本‘鲁光’作对照,建立了核桃亲子鉴定方法,主要实验结果如下:1.在采用表型性状的测试中,仁重和单果重的最大值和最小值有较明显差异,其它表型性状差异较小。各待测品种的坚果表型性状矩阵相关分析结果在0.994-0.999之间,‘鲁果2号’与假定亲本的矩阵相关分析结果在0.998-1.000之间,表明各品种间的表型性状差异很小,亲缘关系很近,不能确切鉴定出子代亲本。2.从已报道的32对黑核桃SSR引物中,筛选出10对带型简单的稳定多态性单位点核桃SSR引物,通过检测20个核桃品种,10个SSR基因座共检测到47个等位基因,其中WGA-070引物检测到最多7个等位基因, WGA-071和WGA-118引物只检测到3个等位基因,平均等位基因数为4.7个。3.采用SSR分型结果分析,对照子代‘Slz-40’和其已知亲本‘鲁光’之间的遗传符合孟德尔遗传规律,而子代‘鲁果2号’与疑似亲本‘丰辉’、‘元丰’、‘香玲’和‘岱丰’之间的基因遗传违反孟德尔规律,出现了完全不同的等位基因位点,所以,可排除它们之间具亲缘关系;子代‘鲁果2号’与疑似亲本‘上宋6号’和‘鲁香’之间的基因遗传方式符合孟德尔规律,所以,判定它们之间具亲缘关系。在表型性状差异极小的近缘核桃品种亲子鉴定中,应用该方法可以鉴定出待检品种的亲本。4. SSR聚类分析显示,9个品种在阀值0.6处分为两个类群(SG1和SG2),‘香玲’与其它品种亲缘关系较远,单独形成类群SG2,其它品种形成类群SG1。在阀值0.91处,类群SG1中‘鲁果2号’与‘上宋6号’和‘鲁香’聚在一组,‘Slz-40’与‘鲁光’聚在一组,进一步证明这种方法的可靠性。5.利用AFLP方法对供试的9个品种进行了分析,共扩增出1480条条带。遗传相似系数最高的是‘鲁果2号’和‘元丰’(为0.9026),其次是‘鲁香’(为0.9005),再次是‘上宋6号’(为0.8978),AFLP聚类分析结果中,9个品种在阈值为0.86处分成三个AFLP群AG1含有两个核桃品种,即‘Slz-40’和‘岱丰’;AG2含有三个核桃品种,即‘丰辉’、‘鲁光’和‘香玲’;AG3囊括了其余4个核桃品种,聚类分析与遗传相似系数分析结果一致。AFLP亲子关系分析发现与‘鲁果2号’亲缘关系最近的三个核桃品种,但未能判断哪两个是其亲本,且对照分析结果与实际不符,表明AFLP用于亲缘关系极近的亲子关系分析有待商榷,需要做进一步研究。