平顶山地区PRRSV分离株的三种结构蛋白基因遗传变异分析

来源 :河南师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ruoling863
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猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome, PRRS)是造成目前养猪业严重经济损失的主要疾病之一。PRRS的临床表现为母猪流产、早产、死胎、断奶仔猪肺炎、生长迟缓且常常引起其他病原继发感染。  国内外相关研究表明:PRRSV不同分离株的核苷酸序列存在明显差异。依据血清学实验和基因序列分析的结果,可将PRRSV分为两种基因型,即美洲型(代表毒株为:ATCCVR-2332)和欧洲型(代表毒株为:LV),两者核苷酸序列同源性约为60%,其中ORF5的同源性仅为54%。研究表明:由PRRSV ORF5、ORF6、ORF7基因分别编码的囊膜糖蛋白GP5(E)、膜蛋白GP6(M)、核衣壳蛋白GP7(N)是PRRSV的三种主要结构蛋白,不同国家和地区的分离株的ORF5基因差异较大。  通过利用Marc-145细胞从平顶山不同地区发病猪场采集的病料中分离出7个毒株,参考Genbank发表的猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)ATCC VR-2332的保守序列设计扩增引物,扩增PRRSV基因组中的ORF5、ORF6~7序列,并对所扩增的序列进行序列测定。测序结果通过DNAstar软件进行分析,和以往Genbank发布的PRRSV序列进行比对和分析,本研究分离的7个平顶山株的ORF5与美洲型代表株VR-2332的核苷酸的序列的同源性为88.9%~90.2%;ORF6~7的为93.9%~94.8%;与欧洲型代表株LV的核苷酸的序列的同源性为63.3%~64.2%;ORF6~7的为67.5%~68.1%,故本研究分离的7个平顶山株应均属于美洲型。  平顶山地区PRRSV ORF5基因序列之间同源性分别为为95.7%~100%;与HB-1、CH-1a、BJ-4、TW、VR-2332、LV等参考型毒株核苷酸序列同源性为96.4%~97.2%、95%~96%、88.1%~89.4%、89.1%~90.9%、88.9%~90.2%、63.3%~64.2%;同源性分析显示同一地域分离株间ORF5基因序列同源性相对较高,不同地域分离株之间的同源性较低,但它们之间存在交叉,没有明显的地域差异。提示病毒在自然环境中随着时间的推移和当地自然环境及疫苗压力作用下,沿着不同方向进化。
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