Twist基因RT-PCR方法的建立和PAB-Gal4-DBD-HA-twist重组质粒的制备

来源 :泸州医学院 西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jacob888888
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本研究分为二部分: 第一部分、Twist基因RT-PCR方法的建立 目的:Twist是胚胎发育相关基因,编码一种在胚胎发育中起关键调控作用的转录因子,在诱导细胞移动及组织塑型中起重要作用。新近发现twist具有癌基因的特征,在人类肿瘤的发生、发展、愈后、复发中具有重要作用,在人类多种恶性肿瘤中高表达,在正常组织和恶性程度低的癌细胞中无或极低表达。Twist—因GC含量高(75%),局部区域GC含量高达90%以上,有连续的30个GC(NM—000474),具有复杂的二级结构,其逆转录聚合酶链式反应(Reverse transcription polymerase chain,RT—PCR)方法的建立是一项相当困难而又费力费时的工作。本课题以肾癌细胞系786—0、肝癌细胞系HepG2、胃癌细胞系MNK和人正常乳腺细胞系Hs578Bst为研究对象,建立twist基因的RT—PCR方法,为探讨twist在肿瘤尤其在肾癌中的作用机制奠定方法学基础。 方法:苏复液氮冻存的肾、肝、胃癌细胞和正常乳腺细胞株,加入RPMI1640液培养(含10%的小牛血清),置于CO2培养箱中(5%CO2、95%空气、37℃)培养,24h更换培养液,以后每2~3 d更换一次,倒置相差显微镜下观察细胞生长情况,待细胞生长铺满培养瓶底时传代或提取RNA。用RNA simple Total RNA kit提取细胞内总RNA,1%的琼脂糖凝胶电泳检测RNA完整性,紫外分光光度计定量检测浓度、纯度。cDNA合成按照Quantscript RT kit Quant cDNA第一链合成试剂盒说明书操作合成。PCR扩增所用引物设计根据GeneBank中的TW/ST(NM_000474)基因序列,运用Primer5.0引物软件并结合Olig06.0的评价分析,最后经Blast检索以确保每条引物与基因库人类已知的其它基因无同源性,同时以GAPDH为内参照基因并设计其引物。PCR扩增操作按照TAKARA公司的LA Taq with GC Buffer PCR试剂盒说明书,设置PCR反应体系并优化扩增反应条件,扩增产物经2.5%琼脂糖凝胶电泳后,照相保存。 结果:(1)总RNA的质量:提取的总RNA通过紫外分光光度计测量,A260/A280在1.80~2.10之间,A260/A2301.90~2.20之间,浓度大于300 ng/μl,通过1%琼脂糖凝胶电泳后,28S带比18S带明显,灰度比大于1,无拖尾;(2)采用TAKARA的LA Taq with GC buffer PCR试剂盒,通过PCR方案的优化,在肾癌细胞系786—0、肝癌细胞系HepG2和胃癌细胞系MNK中均扩增出twist基因的特异表达带。 结论:(1)成功摸索出了具有复杂二级结构、富含GC的twist基因的RT—PCR扩增方法;(2)RT—PCR结果显示在肾癌细胞系中存在twist基因的特异表达。 第二部分、PAB-Gal4-DBD-HA-Twist重组质粒的制备 目的:TWIST蛋白是一种在胚胎发育中起关键调控作用的转录因子,属于碱性的螺旋一环一螺旋(bHLH)蛋白家族成员,在不同的种属之间其核苷酸和氨基酸序列高度保守,其能与DNA上E—BOX的5’—CANNTG—3’序列结合并且能借助HLH形成特定的同源或异源二聚体,广泛参与调控器官生长发育、肿瘤发生、细胞增殖分化等过程,并赋予细胞迁移的能力,还能介导上皮细胞一间叶细胞的转变(Epithelial—Mesenchymal transition,EMT)及细胞的迁移,是上皮间质变过程中的重要调控因子。本实验拟采用PCR和分子克隆技术,构建人Twist基因的表达载体pAB—Ga14—DBD—HA—Twist,为进一步研究其转录调控作用提供实验工具。 方法:(1)设计带有酶切位点BamHⅠ和HindⅢ的特异引物,对重组克隆质粒pcDNA—Flag—Twist进行PCR扩增,得到含有酶切位点的Twist基因编码区全长序列:(2)对含有酶切位点的Twist基因全长片段和pAB—Ga14—DBD—HA表达载体进行BamHⅠ和HindⅢ双酶切反应,电泳分离,胶回收纯化后,进行连接反应;(3)将连接反应产物转入感受态大肠杆菌中,过夜培养;(4)菌落PCR,提取阳性重组质粒作限制性内切酶分析和序列测定。 结果:(1)限制性核酸内切酶酶切鉴定表明,构建的重组质粒中含有与Twist基因编码区全长一致的650 bp片段;(2)DNA测序结果经BLAST分析显示:与GenBank数据库twist基因(NM_000474)序列完全一致,同源性为100%。 结论:成功构建了人twist基因的表达质粒,为下一步研究分析twist基因的表达调控作用和机制奠定基础。
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