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马铃薯Y病毒(Potato virus Y, PVY)是危害马铃薯和烟草的重要病毒,严重影响马铃薯和烟草生产。国外已有大量关于侵染马铃薯的PVY病毒特性和株系多样性的研究,然而国内外关于侵染烟草的PVY的研究甚少,对于广西的研究更是空白。本研究对侵染广西烟草并引起烟草脉坏死的分离物GX-1、GX-2、GX-3及引起烟草系统性斑驳的分离物GX-4的血清学和全长序列进行了测定。血清学鉴定结果表明这四个分离物均与PVYO+C抗体呈阳性反应。利用RT-PCR方法分段克隆了四个PVY分离物全长基因组序列,除了3’末端poly(A)尾巴,GX-1全长9699nt, GX-2和GX-4全长9702nt,GX-3全长9703nt,四个分离物基因组均含有一个大的开放阅读框,均编码由3061个氨基酸组成的多聚蛋白,这一多聚蛋白被3个蛋白酶分成10个功能蛋白。通过对全基因组核苷酸的同源性比较分析,GX-1、GX-2、GX-3和GX-4与20个已报道PVY分离物的核苷酸同源性分别在89.8%～98.6%、88.4%～99.7%、88.5%～99.7%和89.3%～96.1%之间。GX-1、GX-2和GX-3的Hc-Pro上均含有控制PVY在烟草上引起坏死症状的D205、K400和E419氨基酸,但GX-4的Hc-Pro上400位氨基酸为R。重组分析发现GX-1、GX-2和GX-3均是普通株系(PVYO)和烟草脉坏死株系(PVYN)分离物的重组体,GX-1具有4个重组位点,分别位于P1蛋白,Hc-Pro/P3.6K2/VPg及Nib/CP区域,为国内首次报道。GX-2和GX-3具有与湖南马铃薯分离物HN2类似的三个重组位点。系统进化树结果表明,GX-1基因型与PVYN-Wi株系的Wilga156分离物及PVYNTN-NW株系的SYR-Ⅱ-2-8、SYR-Ⅱ-DrH、SYR-Ⅱ-Bel分离物亲缘关系最近,GX-2、GX-3与PVYNTN株系的Guiding-3和HN2分离物亲缘关系最近；而GX-4基因型属于PVYN株系。